修改专利申请文件有以下四种方式：

1、主动修改：申请人可以在被授予专利权之前随时撤回专利申请；

2、被动修改：经审查，国家知识产权局发现专利申请中不符合法律规定，发出更正通知或审查意见通知，要求申请人修改申请文件；

3、国家知识产权局根据职权进行修改；

4、修改内容较多时，提交重新打印的更换页和修改对照表。当修改内容较少时，提交重新打印的替换页和修改的对照页。申请人在提交重新打印的替换页时，提交直接修改的对照页，使审查员更容易检测到修改的内容。

专利申请文件的组

申请发明专利的，申请文件应当包括：发明专利请求书、摘要、摘要附图（适用时）、说明书、权利要求书、说明书附图（适用时），各一式两份。

涉及氨基酸或者核苷酸序列的发明专利申请，说明书中应包括该序列表，把该序列表作为说明书的一个单独部分提交，并与说明书连续编写页码，同时还应提交符合国家知识产权局规定的记载有该序列表的光盘或软盘。

申请实用新型专利的，申请文件应当包括：实用新型专利请求书、摘要、摘要附图（适用时）、说明书、权利要求书、说明书附图，各一式两份。

申请外观设计专利的，申请文件应当包括：外观设计专利请求书、图片或者照片（要求保护色彩的，应当提交彩色图片或者照片）以及对该外观设计的简要说明，各一式两份。提交图片的，两份均应为图片，提交照片的，两份均应为照片，不得将图片或照片混用。

申请专利时应填写专利申请请求书（包括名称、发明人或申请人、联系人、申请文件清单等内容）。

专利申请文件是否具有著作权需要根据具体的阶段进行认定，如果在进入公开阶段之前，由于专利申请文本实际上并没有被发表，因而，不享有著作权，申请发明专利的，申请文件应当包括：发明专利请求书、摘要、摘要附图、说明书、权利要求书、说明书附图等。

《中华人民共和国专利法》第三十五条发明专利申请自申请日起三年内，国务院专利行政部门可以根据申请人随时提出的请求，对其申请进行实质审查；申请人无正当理由逾期不请求实质审查的，该申请即被视为撤回。

国务院专利行政部门认为必要的时候，可以自行对发明专利申请进行实质审查。