1、工程质量保证金的含义是：为履行工程在缺陷责任期内的维修责任，建设单位（业主）与施工企业在工程施工合同中约定从应付工程款中提存，为保证施工企业在缺陷责任期内保证工程竣工（交付）验收合格的缺陷（即缺陷），工程施工质量不符合工程建设、设计文件强制性标准的，和合同协议）的维修资金。

工程质量保证金由施工单位（业主）按工程价款结算总额乘以合同约定的比例（一般为5%）直接从施工企业工程计量拨款中扣除，而且利息一般不算。施工企业应当在工程竣工（交付）验收后的缺陷责任期（一般为12个月）内，认真履行合同规定的责任。缺陷责任期满后，应及时向建设单位（业主）申请退还工程质量保证金。施工单位（业主）应及时向施工企业退还工程质量保证金（缺陷责任期内如有缺陷，应扣除相应的缺陷维修费用）。第二，新规定的工程质量保证金第四，预留的工程质量保证金可由第三方托管。根据《办法》，社会投资项目采取预留保证金方式的，开发商和承包人可以约定将保证金委托给“第三方”金融机构。虽然旧办法对工程质量保证基金托管也有类似规定，但该办法特别强调了托管金融机构的“第三方”属性。希望通过第三方托管机构的监督，使工程质量保证基金专款专用，避免质量保证基金迟延返还，解决发包人挪用、扣留工程质量保证基金的情况，造成施工企业权益受损。然而，由于这一规定并非强制性规定，能否在实践中顺利被接受并不乐观。

在《办法》颁布前（特别是《关于清理保证金的通知》颁布后），一些省份对工程质量保证金第三方托管采取了具体措施。根据《办法》第三条的规定，发包人应在投标文件中明确保证金的预留和返还，并在合同条款中与承包人约定以下有关保证金的事项：

（一）保证金预留和返还方式；

（二）保证金预留比例和期限<（3）定金是否支付利息，如利息、利息的计算方法；（4）缺陷责任期的期限和计算方法；（五）定金的保留、返还和工程维修质量、费用纠纷的处理程序；（六）缺陷责任期内的缺陷索赔方式；（七）逾期返还定金违约金的支付方式和违约责任。其中，第（七）项是《办法》的新内容。