主要有以下几个方面：

1.农民劳动力市场供大于求，导致农民工在就业中无序竞争。

2.农民工从业的随意性和松散性，造成农民工权益维护困难。

3.农民工文化程度偏低，缺乏相应的法律知识和维权意识。

4.保障制度难以落实

一、农民工权益保护的对策

法律救济方面：

1.认真落实我国相关法律中对农民工权益保护的规定。

2.在涉及农民工权益的具体司法实践中，在法律规定的限度内向农民工一方实行“司法倾斜”，对侵害农民工权益者实施更严厉的惩处，对施害者起到警示惩戒作用。

3.简化解决纠纷的法律程序，为农民工提供一条维权的“便捷通道”。

4.建立专门的维护农民工权益的无偿法律救助机构，鼓励法律志愿者积极参与，解决农民工的疑难问题，帮助农民工在合法权益受到侵害的时候进行诉讼，以维护农民工的各项合法权益。

社会救济方面：

1.重视发挥新闻舆论在维护农民工合法权益方面的导向和监督作用，更好地维护农民工合法权益

2.劳动和社会保障、工会、妇联、教育、工商等部门的积极参与，开辟多种农民工维权渠道。

3.开辟维权热线，使农民工的权利及时得到维护。

4.建立维权监督、举报制度，使农民工权益受损的情况及时反馈给有关部门。

加强对农民工的培训，提高农民工的素质为流出地的责任：

1.加大农村教育经费投入，提高农村劳动力的整体素质。

2.改变农村教育模式，培养适合农村及社会发展需要的人才。

3.加大对农村转移劳动力的职业技能培训。

4.加强对农村转移劳动力法律知识的培训。

流入地主要应从以下方面努力：

1.加大对农民工岗前或其他职业技能的培训。

2.是为农民工接受继续教育提供便利。

3.是为农民工子女接受教育创造条件。

二、政府责任

1.政府拥有宏观调控的权力，可以界定产权、配置资源、调整结构；

2.政府握有行政法规制定权，可以依据宪法的原则不断完善针对农民工的各种法规，约束对农民工的政策歧视和待遇不公，尽可能地使农民工享有公民和居民待遇；

3.政府有权通过各种手段(经济的、法律的)对于拖欠克扣工资、劳动条件恶劣、无劳动安全保障措施的企业进行治理；

4.政府可以推动针对农民工的法律援助；

5.政府可以进行保护农民权益的宣传，扩大影响；

6.政府可以支持组建农民工维权组织；

7.政府可以在就业信息的发布、市场培育等方面发挥行政指导的作用；