公司惩罚员工加班不给加班费不合法。在处罚的基础上，超过法定标准部分的加班加点，公司仍然要依法结算加班费。根据《国务院关于职工工作时间的规定》，标准工时制是每天工作8小时，每周工作40小时的标准。工作日后延长工作时间称之为加点，休息日、法定节假日提供劳动称之为加班。

《劳动法》第四十一条规定：用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。可见，加点每天的上限是3小时，而加班加点累计一个月不能超过36小时。

《劳动保障监察条例》第二十五条规定：用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。劳动者遇见超过法定标准的加班加点，可以向当地劳动监察部门举报，由他们介入调查。查证属实的，劳动监察部门可以依法给予处罚。

一、延长工作时间可以不受限制的情形

我国《劳动法》第四十二条规定，有下列情形之一的，延长工作时间不受本法第四十一条规定的限制：

（一）发生自然灾害、事故或者因其他原因，威胁劳动者生命健康和财产安全，需要紧急处理的；

（二）生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的；

（三）法律、行政法规规定的其他情形。

我国《国务院关于严格制止企业滥发加班加点工资的通知》中规定可以延长工作时间的：

在法定节日和公休假日内工作不能间断，必须连续生产、运输或营业的；

必须利用法定节日或公休日的停产期间进行设备检修、保养的；

由于生产设备、交通运输线路、公共设施等临时发生故障，必须进行抢修的；

由于发生严重自然灾害或其他灾害，使人民的安全健康和国家资财遭到严重威胁，需要进行抢救的；

为了完成国防紧急生产任务，或者完成上级在国家计划外安排的其他紧急生产任务，以及商业、供销企业在旺季完成收购、运输、加工农副产品紧急任务的。