根据《刑事诉讼法》相关规定,公安机关在冻结款项时,如确定属于非法所得,则应予以没收,经查明与案件无关的则应予以退还。同时,查封、扣押的财产、文件也应妥善保管或封存,不得使用、更换或损坏。对于与案件无关的财产和文件,应在三日内解除查封、扣押、冻结,并予以退还。

公安机关冻结的款项,经核查确定属于非法所得的,应当予以没收;如果经查明与案件无关,则应当退还,不存在能否扣除非法所得的问题。

《刑事诉讼法》第一百四十一条规定，在侦查活动中发现的各种可以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的财产和文件，应当查封、扣押；与案件无关的财产和文件不得查封或者扣押。

对于查封、扣押的财产、文件，应妥善保管或封存，不得使用、更换或损坏。

《刑事诉讼法》第一百四十五条规定，查封、扣押的财产、文件、邮件、电报或者冻结的存款、汇款、债券、股票、基金份额等财产，经查明与案件无关的，应当在三日内解除查封、扣押、冻结，并予以退还。

能否用查封的款项抵扣借款？

根据我国《民法典》第六百一十三条的规定，债务人可以将自己的动产或者不动产抵押给债权人以作为债权的担保。而根据该法第六百一十四条的规定，债务人或者第三人有权处分的财产权利可以出质。因此，债务人或者第三人可以将自己的动产或者不动产出质，以作为债权的担保。

同时，《民法典》第六百一十三条也明确规定了，债务人或者第三人有权就自己的动产或者不动产优先受偿。因此，在债务人无法偿还债务时，债权人可以通过查封债务人的动产或者不动产，以获取优先受偿权。

然而，根据《民法典》第六百一十三条的规定，查封的款项并不能直接用于抵扣借款。因此，债务人或者第三人用查封的款项抵扣借款的行为是不被允许的。

综上所述，根据我国《民法典》的相关规定，债务人或者第三人用查封的款项抵扣借款是不被允许的。债权人应当依照法律规定，通过合法途径追讨债务。

结语：根据我国《民法典》的相关规定，债务人或者第三人用查封的款项抵扣借款是不被允许的。债权人应当依照法律规定，通过合法途径追讨债务。

《刑事诉讼法》第一百四十一条

在侦查活动中发现的可用以证明犯罪嫌疑人有罪或者无罪的各种财物、文件，应当查封、扣押；与案件无关的财物、文件，不得查封、扣押。

对查封、扣押的财物、文件，要妥善保管或者封存，不得使用、调换或者损毁。

第一百四十五条

对查封、扣押的财物、文件、邮件、电报或者冻结的存款、汇款、债券、股票、基金份额等财产，经查明确实与案件无关的，应当在三日以内解除查封、扣押、冻结，予以退还。