职务侵占罪的认定应遵循以事实为依据、以法律为准绳的基本原则。侦、控、审三部门搜集、采信的证据除必须具备客观性、关联性和合法性等三个条件特征，职务侵占罪的证据必须与本罪构成要件紧密关联外。

认为认定职务侵占罪的证据体系还需要从以下几方面加以考虑：

1、调取有关被害单位的企业注册登记资料和劳动合同，证实犯罪嫌疑人的职务、身份的证据材料，以确定犯罪主体。

2、犯罪嫌疑人所占有的财物是否为利用职务上便利的证据材料。

3、调取财物账目等有关犯罪对象和数额的证据，并由司法会计审计部门作出审计鉴定报告。

4、根据犯罪嫌疑人的作案手段，收集相关的物证，如用来平帐的假发票，伪造、变造的有关帐目的凭证等。

5、犯罪嫌疑人所侵占财物的去向的证据材料，如挥霍、还债等。

6、追缴的赃款、赃物，根据需要进行拍照固定证据，并由估价部门对赃物作出估价鉴定。

7、有必要的对提取的文字材料进行文字鉴定。

8、询问案件涉及的参与人、知情人、关系人，获取案件有关事实和证据。

9、审讯犯罪嫌疑人，应问清：

(1)犯罪的动机、目的；

(2)犯罪的手段、方法，重点在于是否利用职务之便将本单位财物非法占有；

(3)犯罪的时间、地点、次数、作案过程；

(4)赃款、赃物的去向；

(5)有共同犯罪的问清预谋、分工情况，区分地位、作用，确认分赃情况等。

二、职务侵占罪取证的内容

在职务侵占刑事案件审理判决中，有效证据主要是针对这些犯罪嫌疑人的身份、取得占有财物的方式等，包括物证、书证，证人证言，犯罪嫌疑人供述、受害人陈述、勘验笔录、视听资料等能证明案件的事实经过的，都属于有效证据。

现在我国刑事诉讼法还规定了非法证据排除制度，可以对非法取得的证据要求法院审理时候不予采纳。

《刑法》

第二百七十一条公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处五年以下有期徒刑或者拘役；数额巨大的，处五年以上有期徒刑，可以并处没收财产。

国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。

《刑事诉讼法》

第五十条可以用于证明案件事实的材料，都是证据。

证据包括：

(一)物证；

(二)书证；

(三)证人证言；

(四)被害人陈述；

(五)犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解；

(六)鉴定意见；

(七)勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录；

(八)视听资料、电子数据。

证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。

第五十六条采用刑讯逼供等非法方法收集的犯罪嫌疑人、被告人供述和采用暴力、威胁等非法方法收集的证人证言、被害人陈述，应当予以排除。收集物证、书证不符合法定程序，可能严重影响司法公正的，应当予以补正或者作出合理解释；不能补正或者作出合理解释的，对该证据应当予以排除。

在侦查、审查起诉、审判时发现有应当排除的证据的，应当依法予以排除，不得作为起诉意见、起诉决定和判决的依据。