擅自离职会有以下法律后果：

1、职工在劳动关系存续期间，未经批准而擅自离职均属无故旷工行为，发生争议以自动离职处理；

2、职工自动离职属于违法解除劳动合同，应当按照违反有关劳动合同规定的赔偿办法承担赔偿责任；

3、劳动者违反规定或劳动合同的约定解除劳动合同，对用人单位造成损失的，劳动者应赔偿用人单位损失，包括用人单位招收录用其所支付的费用，用人单位为其支付的培训费用，对生产、经营和工作造成的直接经济损失及劳动合同约定的其他赔偿费用；

4、用人单位招用尚未解除劳动合同的劳动者，对原用人单位造成经济损失的，除该劳动者承担直接赔偿责任外，该用人单位应当承担连带赔偿责任。

一、员工擅自离职处理方法如下：

1、用人单位应当以书面形式送达通知书，限定员工在指定是时间内回公司上班，并提出如限期内不上班的处理措施；

2、用人单位应当将解除劳动关系的事宜公开，并以书面形式送达离职通知书给员工，通知其前来办理交接工作以及离职手续。

二、离职的一般程序如下：

1、提前1个月提交辞职请求；

2、员工主管与辞职员工积极沟通；

3、辞职申请表经各级领导签署意见审批；

4、员工辞职申请获准，办理离职移交手续。

综上所述，擅自离职会有的法律后果因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。

职工擅自离职、停薪留职期满不归如何处理

原劳动人事部、国家经济委员会《关于企业职工要求“停薪留职”问题的通知》（劳人计［1983］61号）第2条“……对于未经批准而擅自离职的职工，按自动离职处理”。第3条“……停薪留职期满后的1个月以内，本人既未要求回原单位工作，又未办理辞职手续的，原单位有权按自动离职处理”等规定与原劳动人事部颁发的《全民所有制单位技术工人合理流动暂行规定》（劳人劳［1987］14号）第11条：“……对擅自离职的，以旷工论处，可按照《企业职工奖惩条例》的规定，给予除名处理”的规定是一致的。因为未经批准，擅自离职的，或停薪留职期满后1个月以内，本人既未要求回原单位工作，又未办理辞职手续的，均属无故旷工行为，况且旷工时间已够除名规定的期限，所以可按除名处理。原劳动部办公厅劳办力字［1992］45号《复函》重申了以上意见。

5种自动离职有补偿，这5种情况是：以暴力、威胁或者非法限制人身自由的手段强迫劳动；未按照劳动合同约定支付劳动报酬或者提供劳动条件；克扣或者无故拖欠劳动者工资；拒不支付劳动者延长工作时间工资报酬；低于当地最低工资标准支付劳动者工资。

劳动部门指出，遇到上述5种情况，职工提出解除劳动合同，单位又拒付劳动报酬和补偿金，职工可以在规定的时效内申请劳动仲裁，直至向法院起诉，以维护自己的合法权益。

企业用哪些形式通知职工回单位方能对逾期不归者进行处理

根据原劳动部办公厅《关于通过新闻媒介通知职工回单位并对逾期不归者按自动离职或旷工处理问题的复函》（劳办发［1995］179号）的规定，企业通知请假、放长假、长期病休职工在规定时间内回单位报到或办理有关手续，应遵循对职工负责的原则，以书面形式直接送达职工本人；本人不在的，交其同住成年亲属签收。直接送达有困难的可以邮寄送达，以挂号查询回执上注明的收件日期为送达日期。只有在受送达职工下落不明，或者用上述送达方式无法送达的情况下，方可公告送达，即张贴公告或通过新闻媒介通知。自发出公告之日起，经过30日，即视为送达。在此基础上，企业方可对旷工和违反规定的职工按《奖惩条例》的规定做除名处理。能用直接送达或邮寄送达而未用，直接采用公告送达，视为无效。

快速离职不一定会被扣除工资，职员在若是有离职的想法，需要提前一个月通知单位，若是自动离职，单位不会扣除其工资，但是职员需要支付给单位一定数额的赔偿金。需要支付的具体的数额，需要在签订劳动合同时，就协商确定下来。

《中华人民共和国劳动合同法》第九十条【劳动者的赔偿责任】劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。