剩余财产分配方案确定后，应由清算组立即开始执行。破产财产分配完毕，应由清算组提请人民法院终结破产程序。破产程序终结后，未得到清偿的债权不再清偿。在实际工作中，对于不同类型的企业，剩余财产的分配方案应有所不同。对于有限责任公司，一般是按合同、章程的规定或出资者出资比例进行分配。如果公司章程、合同中已专门说明了有关财产的分配办法，则应按规定进行分配;如果没有在合同、章程、协议中作出明确规定，董事会也没有就此作出任何决定的，则应按合资法的规定，按投资各方的股权资本比例进行分配。

企业依法缴纳必要的所得税之后，剩余财产便可以在企业投资者之间进行分配了。剩余财产的分配应根据不同情况，按不同方式来进行。

剩余财产分配以后，清算工作中的财务处理即告完成。这时，清算机构应出具有关报告和报表，并聘请注册会计师对企业清算过程及相应的报告和报表进行审计，并由他们签署审计报告，与上述清算报告一起提交有关机构确认。

如果上述分配方案董事会已经通过并得到审批机构批准，清算组即可按上述方案实施。

一、债权人申请法院清算程序

企业进入破产程序后，由人民法院自宣告之日起15日内成立清算组，清算组由人民法院与同级人民政府协商指定，由相关人员包括律师、会计师等专业人员组成。

刻制清算组图章；在银行开立帐号；、明确清算组的主要职责，并进行内部分工：接管破产企业。包括对破产企业人、财物各方面的管理，接管破产企业印章、财务帐册和凭证、重要文件及合同等。负责破产财产的保管、清理、估价、处理和分配。负责接收破产企业的债务人和财产持有人清偿的债务或交付的财产。决定解除或继续履行破产企业未履行的合同。对破产企业财务进行审计，出具审计报告。对破产债权进行清理，审核债权人申报的债权。对破产企业对外债权进行清理，并依法追讨破产企业对外债权及外在财产。根据需要，要求债权人会议主席或法院召开债权人会议。制定破产财产分配方案，经债权人讨论后报请法院批准执行。在清偿有财产担保的债务后，收回破产企业的担保物。对破产企业于法院受理案件前六个月至破产程序终结的期间，其进行：隐匿、私分或无偿转让财产；非正常压价出售财产；对于原来没有财产担保的债务提供财产担保；对未到期的债务提前清偿；放弃自己的债权等行为，清算组有权向法院申请追回财产。于破产财产分配完毕后，提请法院裁定终结破产程序。破产程序终结后，向破产企业原登记机关办理注销登记。决定破产企业自破产宣告之日起是否继续进行生产经营。