公司合作合同注意事项有：

(一)合同伙投资撤资及职责的相关规定。

(二)意见分歧解决方式。

(三)经营项目计划利益分配和责任承担。

一、股东出资后能否撤资

关于股东是否可以撤资的问题。根据《中华人民共和国公司法》第三条规定，“公司是企业法人，有独立的法人财产，享有独立法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。”也就是说，公司的财产是独立于股东的财产的，股东一旦出资，他出资的财产就转化为公司财产，股东就没有权利予以撤资了，否则涉嫌抽逃出资。当然，也并不是说股东出资后就一定不能撤资，但会有很多的条件和限制。比如股东会或股东大会通过有效决议，同意减少注册资本的情况下，那股东就可以撤资，但程序相对复杂，需要编制资产负债表及财产清单，并且通知债权人等，通过减少注册资本的方式予以撤资。也就是说，只有在充分保障了债权人的权利，并完成了法律上的程序和履行了相应义务后，才可以撤资。

二、合作需要审查哪些问题？

财务审计，尤其是债务情况。

签合同不能代表就入股了，入股是要做股权变更的，这一点很重要，关于公司合资的具体的法规，找工商或者律师事务所是可以查到的，有关事业投资，建议自己去查一下比较靠谱，有了股权的股东，除了有定期分红之外，也是有潜在亏损的危险的，若出现意外情况，会产生需要按比例投入资金，或者撤资、更改股权等等的状况。

所以，投资入股要注意几个方面，原资产评估、投资比例和股东权利分配等，还有就是对公司经营者和领导团队的能力调查，如果公司不盈利，老要掏钱，那不是做赔本生意么，还有被骗的可能。

这个可是太重要了，买卖好做，伙计难搭。股份比例当然按出资比例确定，关键是合作是否默契，如果拿不准，还是考虑清楚，特别是别当小股东，到时候受大股东欺负。关键注意必须拿到出资证明书，签合公司章程。

根据《公司法》的相关规定，现金入股是公司出资方式允许的范围。

如果是现金入股，需要将现金打入公司专门开立的验资帐户内，取得会计师事务所的验资证明。同时，公司股东会应该形成一份新的股东会决议，该决议因涉及增资，应该取得三分之二以上表决权股东的通过。该份股东会决议将成为工商局办理股东及注册资本变更登记的依据。需要注意的是，可以充分了解该公司的运营情况及发展前途。

虽然有限责任公司只就公司资产承担有限责任，但是一个资不抵债的公司就不值得的投资。还有，关于股东表决权是根据公司出资比例来决定，还是通过约定，如果超过三分之二的股权都掌握在一个股东手中，其实该公司就是一言堂公司，也不利于公司的发展。总之一句话，投资需谨慎。

三、股东大会有哪些职责

股东大会的职责有：公司的经营方针和投资计划的决定权、选举和罢免董事和监事的权利、财务方案、利润分配方案等的审批权、重大事项决策权、修改公司章程的权利等。

根据《公司法》第九十八条规定，股份有限公司股东大会由全体股东组成。股东大会是公司的权力机构，依照本法行使职权。

第九十九条规定，本法第三十七条第一款关于有限责任公司股东会职权的规定，适用于股份有限公司股东大会。