两方的债权债务抵消涉税的处理应当根据实际认定，一般是需要交纳相关剩的。《国家税务总局关于加强增值税征收管理若干问题的通知》(国税发[1995]192号)规定，购进货物或应税劳务支付货款、劳务费用的对象。纳税人购进货物或应税劳务，支付运输费用，所支付款项的单位，必须与开具抵扣凭证的销货单位、提供劳务的单位一致，才能够申报抵扣进项税额，否则不予抵扣。

一、税务管理的内容：

1、制度管理

在坚持公有制和按劳分配为主体，其他经济成分和分配方式为补充的基础上，建立和完善社会主义市场经济体制。依此经济体制改革为目标，建立和完善社会主义税收体系，健全税收法制和各项管理制度，强化税收组织收入和宏观调控功能，逐步理顺国家、企业和个人之间的分配关系。同时要制定和贯彻执行税收管理体制，正确处理中央与地方税收管理的权限，充分调动中央和各级地方政府管理税收的积极性。

2、核算和监督

担负税收核算和监督的任务，是税收工作实现科学管理的重要工具。通过计划、会计、统计管理，分析预测税源和税收的发展趋势，为组织收入工作提出明确目标，促进税务管理，增强预见性，减少盲目性，调动各级税务机关和全体税务干部的积极性。

3、征收管理

包括税收的宣传，税收的征收、管理、检查，税收的促产等。科学严密的征收管理，是税务管理的中心环节。通过大量的日常征收管理工作，贯彻执行国家税收政策法令；有效地集中分散在各个方面、各个环节的税收，及时足额地纳入国库；发挥税收调节生产、调节分配、调节消费的职能作用；实现帮助企业加强经济核算、提高经济效益、促产增收工作。

4、干部管理机构

健全税务专业管理机构，完善税务机构、干部管理体制，培养和造就一支政治、业务素质高的税务干部队伍，这是加强税务管理的组织保证。税务机构分散点多、面广，税务干部经常同钱财打交道，手中握有一定权力，又往往是独立进行工作，加强税务机关的思想政治工作和廉政建设至关重要。

两方的债权债务抵消的情况下，一般是不会影响税费的交纳的，因为抵消债务已经构成了商业上的财产转移行为，需要根据相关税收的规定进行处理。特殊情况下，如果是公司内部的债权债务抵消，并不产生经济收税的情况下，可以向司法机关提交相关证明文件，由税务机关对相关税费进行减免。