工厂辞工扣1000元工资是不合理的。任何用人单位都不能随意克扣工人工资，即便是急辞工，即是员工个人原因造成的单位损失，扣工资也不能超过工资额的20%。

一、急辞职厂里扣工资怎么办

通常是指立即解除合同或者短时间内解除合同。有合法与违法之分，应当区别情况分别对待。在用人单位无法定过错情形下，劳动者急辞工的，向用人单位提出急辞工申请的，是与用人单位协商解除合同，用人单位可以拒绝，但不得在同意的情形下扣工资；劳动者直接通知用人单位急辞工的，或者提出申请被拒绝之后擅自离职的，是为违法解除合同。用人单位有过错的情况下急辞职，用人单位应当在解除合同之时一次结清工资，并按劳动者本单位工作年限每年支付一个月本人工资经济补偿金。

二、克扣工人工资怎么办

克扣工人工资有《中华人民共和国劳动法》以及《工资支付暂行条例》等法律法规。

克扣工资按劳动法补偿和赔偿，由劳动监察责令限期支付，逾期不支付的，责令按克扣的额度加付50%至100%的赔偿金。根据相关法律规定，未依法支付劳动报酬、经济补偿等的法律责任，用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿：

1、劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；

2、逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金：

（1）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的；

（2）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的；

（3）安排加班不支付加班费的；

（4）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。

三、个人工厂自离要扣多少天的工资

职工自动离职的，用人单位不得自己随意进行克扣劳动者工资，但如劳动者时自动离职然后因为他们的这一原因给用人单位造成经济损失的，用人单位就进行可以扣工资，但需要承担造成损失的相关举证责任。

依据《工资支付暂行规定》第十六条因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。也就是说，工厂自离扣工资的天数不能多于6天，而且是在员工因为自己的过错导致工厂损失的，才可以进行扣工资，不然扣工资就是不合法的行为。