分公司不具有独立法人资格，可以以分支机构为单独被告，或者是以法人为单独被告，或是以分支机构及法人为共同被告皆可。

分支机构在经营中所引起的责任均可先以分支机构的相对独立财产支付，不足的部分再以法人财产支付。当然，也可以直接执行法人的财产。

实际上，分支机构与法人财产都是法人的财产，分支机构的财产并不具有法律意义上的独立性，故实际上分支机构的责任最终是由法人承担。

一、总公司不配合注销分公司怎么办

没办法。分公司是指在业务、资金、人事等方面受总公司管辖而不具有法人资格的分支机构。分公司属于总公司分支机构，在法律上、经济上没有独立性，不具有企业法人资格，仅仅是总公司的附属机构。分公司没有自己的名称、章程，没有自己的财产，分公司的所有资产全部属于总公司。分公司与总公司在经济是统一核算，其实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。并以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任。

分公司不独立承担民事责任，没有董事会等形式的公司经营决策和业务执行机关，总公司要对分公司的债务负无限责任。

二、法人企业和非法人企业的概念

一、定义上的区别：

1、法人企业是指取得法人营业执照、具有法人地位的企业。相对于非法人企业(如:个人独资企业、合伙企业、公司的分公司等分支机构、等)，法人企业能够以企业自己的名义独立享有法定权利和承担法定义务。也就是说，法定权利直接归企业享有而非企业业主或投资者，同理，法定义务也直接由企业承担而非企业业主或投资者。

2、非法人企业，又称企业非法人，指经工商行政管理机关登记注册，从事营利性生产经营活动，但不具有法人资格的经济组织。企业非法人主要包括个人独资企业、合伙企业、企业的分支机构(分公司、办事处、代表处)等。

二、法律上的区别：

1、根据法律规定，法人企业的法定代表人（如董事长），对外代表企业，其职务行为引起的法律后果，由其所代表的法人企业享有或者承担。

2、非法人企业的法律地位是不具有法人资格，不能独立承担民事责任，不能独立支配和处分所经营管理的财产，但经营单位可以刻制印章、开立往来帐户、单独核算、依法纳税，也可以签订商业合同并作为执行人。