1、一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票发票联复印件留存备查；

2、如果丢失前未认证的，可使用专用发票发票联认证，专用发票发票联复印件留存备查。

分为以下几种情况及处理方式：

(1)使用发票的单位和个人丢失发票，应当与发票丢失当日或次日(节假日顺延)书面报告主管税务机关，并向主管税务机关指定的报刊等媒介刊登公告声明作废。纳税人丢失发票办理丢失声明的，必须在具有全国报刊号的报纸上刊登。

(2)开具发票一方丢失已填开的发票联，应重新开具发票交对方入账。重新开具发票时，应在备注栏填写丢失发票的客户名称、发票种类代码和号码、金额，开票单位。开具发票方记账时附上丢失发票的其他联次作为合法入账凭证。

(3)取得发票一方丢失已填开的发票联，应取得原签发单位盖有公章的证明，并注明原来发票的号码、金额和内容等、由经办单位负责人批准后，才能代做原始凭证。

1、《增值税纳税申报表》及其《增值税纳税申报表附列资料》；

2、使用防伪税控系统的纳税人，必须报送记录当期纳税信息的IC卡、《增值税专用发票存根联明细表》及《增值税专用发票抵扣联明细表》；

3、《资产负债表》和《损益表》；

4、《成品油购销存情况明细表》；

5、主管税务机关规定的其他必报资料。纳税申报实行电子信息采集的纳税人，除向主管税务机关报送上述必报资料的电子数据外，还需报送纸介的《增值税纳税申报表》。

综上所述，凡是已经认定为是普通纳税人的企业，必须要通过防伪税控系统开具增值税专用发票。如果不是防伪税控系统开具的增值税专用发票，是不可以申报进项税额抵扣的。普通纳税人在正常的经营中没有规定增值税专用发票的使用期限，但是已经被取消一般纳税人资格的纳税人，必须要及时缴纳并注销，包括空白的专用发票和专用发票的存根。

一、增值税普通发票丢失如何处理

分为以下几种情况及处理方式：

(1)使用发票的单位和个人丢失发票，应当与发票丢失当日或次日(节假日顺延)书面报告主管税务机关，并向主管税务机关指定的报刊等媒介刊登公告声明作废。纳税人丢失发票办理丢失声明的，必须在具有全国报刊号的报纸上刊登。

(2)开具发票一方丢失已填开的发票联，应重新开具发票交对方入账。重新开具发票时，应在备注栏填写丢失发票的客户名称、发票种类代码和号码、金额，开票单位。开具发票方记账时附上丢失发票的其他联次作为合法入账凭证。

(3)取得发票一方丢失已填开的发票联，应取得原签发单位盖有公章的证明，并注明原来发票的号码、金额和内容等、由经办单位负责人批准后，才能代做原始凭证。