农民工工资保证金一般是由有关的单位进行缴纳，在有关的单位不能支付工资的时候，这些保证金用于支付农民工的工资，因此缴纳的话一般是到社会保障部门。

农民工工资保证金，是指在工程开工之前，由建设工程项目审批行政部门负责通知，并监督建设单位按照工程合同价款的3％向银行专户存储的工资专项资金。保证金根据省、市、县各级项目审批权限实行层级监管，并实行专户存储、专项支取，任何单位和个人不得挪用。

农民工工资保证金交到哪个部门

（一）农民工欠薪保证金交到劳动保障行政部门指定的银行。未经主管部门许可，任何单位不得减、免、缓缴工资保证金，不得动用工资保证金账户或挪作他用。

实行工资保证金的目的，是为了保障农民工的利益，避免出现拖欠农民工工资的情况，更好的维护农民工弱视群体的权益。出现下列情形之一的，经劳动保障部门查证属实后可以支取保证金清偿农民工工资：

1、建设企业未依法及时结算农民工工资，拖欠农民工工资的；

2、建设单位或建设企业非法转包、分包建设工程，导致用工主体不具有法人资格而发生拖欠农民工工资行为的；

3、建设单位或建设企业法人代表或工程负责人隐匿逃跑或死亡，造成拖欠农民工工资的；

4、其他被认为拖欠农民工工资的。

《农民工工资保证金管理暂行办法》

第三条本办法所称工资保证金，是指以强制性措施要求发生过拖欠农民工工资行为的建筑施工企业，在建设项目开工前按照规定比例向民丰县劳动保障行政部门指定的银行专用账户存入的专项资金，未经劳动行政部门许可，任何单位不得减、免、缓缴工资保证金，不得动用工资保证金帐户或挪为他用。在企业未能及时支付农民工工资时，用于支付农民工工资的保障资金。

第四条县劳动保障行政部门是农民工工资保证金制度实施的主管部门，建设、水利、交通、国土资源等行政部门和银行机构按照职责共同负责农民工工资保证金制度的实施工作。

第五条劳动保障行政部门］指定银行设立农民工工资保证金统一专户。银行机构在统一－专户项下为各建筑施工单位分别建立单位帐户。