一、支付的工伤赔偿是否要扣个税

根据相关条例的规定，职工因为工伤事故取得的工伤赔偿，包括一次性伤残补助金、一次性就业补助金和一次性医疗补助金、工伤医疗待遇等，是不用缴纳个人所得税的。

如果单位没有按照规定为职工缴纳工伤保险，出现工伤事故，相关补偿费用需要由单位来支出，只要职工取得的这笔所得符合《工伤保险条例》规定的工伤保险待遇范围，就能免征个人所得税。

其中，对停工留薪期工资是否缴纳个人所得税，理解和做法存在争议。

有人认为，停工留薪期工资属于工伤保险待遇的一部分，所以不应该缴纳个人所得税。

也有人提出质疑，工伤保险待遇的具体内容中并不包含停工留薪期工资，并且工伤职工停工留薪期工资是按照原工资标准发放，应该属于工资薪金范围，所以需要缴纳个人所得税。

二、工伤赔偿程序该怎么走

1、工伤报告程序。单位应当自工伤事故发生之日或者职业病确诊之日起15日内，向当地劳动行政部门提出工伤报告。

2、工伤认定程序。单位没有提起工伤认定的，工伤者一定要在事故发生之日起一年内向劳动部门提出申请。社保经办机构调查认定后，书面通知单位及伤者。

3、工伤鉴定程序。在申请工伤鉴定的职工被认定为工伤的基础上（即走完工伤认定程序后），在其医疗终结或医疗期满之后，由县以上劳动鉴定委员会对其进行的评定伤残等级的行为。

4、协商赔偿程序。单位投了工伤保险的，就直接由国家工伤保险机构依据标准发放工伤保险待遇。没有投保的，则依据标准与用人单位协商解决。

5、劳动仲裁程序。与用人单位协商解决不了的，则可以依据劳动仲裁法规提起仲裁程序。

6、法院审理程序。对劳动仲裁不服的，可以向法院提起诉讼解决。对一审法院判决不服的，可以依法向二审法院提起上诉。

7、执行程序。仲裁或者判决生效后，用人单位不支付赔偿费的，则可以依据生效法律文书向法院执行局提起执行申请，由法院执行。

8、申诉程序。对生效判决不服的，则可以申请启动再审程序，但这一般很难。

根据规定，在进行工伤认定以及对工伤赔偿数额的计算后，双方可以就该赔偿的赔偿方式以及赔偿数额等问题进行协商，可以协商解决的，那最好。不能协商解决的，劳动者为了维护自身的权益，只能采用仲裁和诉讼的方式进行。