检察院让签认罪认罚后不起诉是合法的。

1、根据法律规定，检察院对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

2、构成刑事犯罪的，要依据触犯的罪名，根据犯罪的事实、犯罪的性质、情节和对于社会的危害程度等因素，依据刑法规定的标准进行处罚。

一、检查院不起诉如何办理取保候审手续

检查院不起诉办理取保候审手续：检察院不起诉，不需要办理取保候审手续。检察院不起诉后，需要将不起诉决定送达被不起诉人及其所在单位。被不起诉人在押的，应当立即释放。犯罪嫌疑人无犯罪事实的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉的决定。人民检察院对犯罪情节轻微，不需要依照刑法判处刑罚或者免除刑罚的，可以作出不起诉的决定。

二、不起诉制度是什么

不起诉制度可分为以下几种：1、法定不起诉是指具有相关规定情形之一的，检察院应当作出不起诉决定；2、酌定不起诉是指对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出不起诉决定；3、证据不足不起诉是指对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。

三、不起诉的种类有哪些

不起诉分为法定不起诉和酌定不起诉。

根据我国刑事诉讼法相关规定，我国不起诉的类型有两种法定不起诉和酌定不起书。

法定不起诉有以下情形：

1、犯罪情节显著轻微；

2、犯罪已过追诉时效；

3、犯罪分子被赦免；

4、亲告罪，没有告诉撤回的；

5、犯罪分子死亡的。

酌定不起诉，是指人民检察院对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的案件，可以作出不起诉决定。

酌定不起诉的情形主要有在中国领域外犯罪依照我国刑法规定应当负刑事责任，但在外国已受过刑罚处罚的；2聋、哑、盲人犯罪的；防卫过当；避险过当；预备犯的行为；没有造成损害的中止犯的行为；从犯的行为；胁从犯的行为；自首且犯罪较轻的；有重大立功表现的；犯罪后自首又有重大立功表现的。酌定不起诉从法律上说是对犯罪嫌疑人作无罪处理。