劳动者违反竞业禁止义务，自营或参与他人经营同类营业，并使用或许可他人使用用人单位的商业秘密时，即存在违约和侵权的竞合。对此用人单位可以择一行使请求权。

首先，《劳动法》第22条规定，劳动合同当事人可以在劳动合同中约定保守用人单位商业秘密的有关事项。因此，如果用人单位与劳动者在劳动合同中规定了保密义务或竞业禁止义务，那么，保密义务或竟业禁止就成为劳动权利义务内容的一部分，因此，如果原用人单位与劳动者之间因履行该条款而发生的纠纷，应属于劳动争议仲裁委员会的受理范围，用人单位可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对此，《劳动和社会保障部办公厅关于劳动争议案中涉及商业秘密侵权问题的函》(劳社厅函1999]69号)规定：劳动合同中如果明确约定了有关保守商业秘密的内容，由于劳动者未履行，造成用人单位商业秘密被侵害而发生劳动争议，当事人向劳动争议仲裁委员会申请仲裁的，仲裁委员会应当受理，并依据有关规定和劳动合同的约定作出裁决。其次，如果劳动者违反竞业禁止义务，自营或参与他人经营同类营业，并使用或许可他人使用用人单位的商业秘密时，用人单位可以直接向人民法院提起侵害商业秘密的诉讼。

如果劳动者在离职后违反竞业禁止协议到与原用人单位有竞争关系的公司工作，但是劳动者是否使用或者允许他人使用原用人单位的商业秘密很难取证，那么，用人单位提起侵害商业秘密的诉讼的风险较大，申请劳动仲裁无疑是一个更为明智的选择，因为无论是否侵害商业秘密，劳动者违反竞业禁止协议的，就应当根据竞业禁止协议的内容承担相应的违约金。

竞业禁止诉讼是民事纠纷，还是劳动纠纷？竞业禁止属于商业秘密保护中的一个重要方面，如果原用人单位起诉劳动者从事与原单位相同或相类似的业务或服务从而构成不正当竞争，尤其是侵害原单位商业秘密的，此时违反竞业禁止约定已经成为侵犯他人权利的手段，该争议已转化为普通的民事纠纷，不应再受劳动争议仲裁前置程序的约束。在实践中，大量发生的案例则是原用人单位以侵害商业秘密为由对劳动者和新用人单位提起诉讼。