劳动合同里面注明两年之内不能怀孕是不合法的，无效的劳动合同，从订立的时候起，就没有约束力。但是处理无效劳动合同，要区分劳动合同全部无效和部分无效。涉及合同基本关系和主体资质导致合同无效的，应属于合同的全部无效。

《劳动合同法》

第二十六条

下列劳动合同无效或者部分无效：

(一)以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的;

(二)用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的;

(三)违反法律、行政法规强制性规定的。

对劳动合同的无效或者部分无效有争议的，由劳动争议仲裁机构或者人民法院确认。

第二十七条

劳动合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。

第八十六条

劳动合同依照本法第二十六条规定被确认无效，给对方造成损害的，有过错的一方应当承担赔偿责任。

一、劳动合同被确认无效，劳动者已付出劳动的怎么赔偿？

根据《劳动合同法》第二十八条，劳动合同被确认无效，劳动者已付出劳动的，用人单位应当向劳动者支付劳动报酬。劳动报酬的数额，参照本单位相同或者相近岗位劳动者的劳动报酬确定。

第二十六条，下列劳动合同无效或者部分无效：

(一)以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；

(二)用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的；

(三)违反法律、行政法规强制性规定的。

对劳动合同的无效或者部分无效有争议的，由劳动争议仲裁机构或者人民法院确认。

第二十七条，劳动合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。

二、无效劳动合同是什么

无效劳动合同是指对当事人不发生法律约束力的劳动合同。《劳动合同法》第二十六条规定的无效或者部分无效的劳动合同是：以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的；违反法律、行政法规强制性规定的。无效劳动合同，从订立的时候起，就没有法律约束力，如果给对方造成了损害，应当依照法律规定承担赔偿责任。