《劳动合同法》明确规定了对劳动者约定违约金只有两种情形：一是在竞业限制约定中；二是服务期协议中。因此，用人单位不能对劳动者违反保密协议约定违约金。按照法律规定，劳动者违反保密协议的，用人单位只能主张损害赔偿而不能要求其支付违约金。

一、企业与员工签订保密协议有什么作用

（一）教育

企业与雇员签订保密协议，可以提高员工保密意识，起到教育员工自觉遵守公司保密规定，履行自己对公司商业秘密保护的责任和义务的作用。

（二）告知

企业通过保密协议，明确向雇员告知本企业存在商业秘密的事实、商业秘密范围、以及雇员对商业秘密必须承担的权利和义务，例如：保守秘密的义务；正确使用商业秘密的义务；获得商业秘密职务成果及时汇报的义务；不得利用单位的商业秘密成立自己企业的义务；不得利用商业秘密为竞争企业工作的义务等。

（三）警告

让雇员清楚的知道违反保密协议规定、非法侵犯企业商业秘密应承担的法律后果和赔偿责任，约束雇员的行为，强化了公司商业秘密的保护力度。

（四）举证

实践中，发生离职员工侵犯公司商业秘密时，争议焦点往往不是员工有没有义务保守公司的商业秘密，而是该秘密是不是构成受法律保护的“商业秘密”，以及单位如何提供证据证明离职员工实施了侵权行为及侵权造成的损失。由于商业秘密侵权证据很难收集，或调查取证的成本非常高，往往导致单位对侵权行为束手无策。通过保密协议，企业可以证明商业秘密的存在、证明企业对商业秘密采取了保护措施，一旦发生侵犯商业秘密的行为，便于举证，有利于企业借助法律手段保护自己的商业秘密，维护合法的权益。

二、员工违反保密协议需要承担什么责任

保密协议是协议当事人之间就一方告知另一方的书面或口头信息，约定不得向任何第三方披露该等信息的协议。许多用人单位会与劳动者签订保密协议以保护公司的商业秘密，员工违反商业秘密依据保密协议的具体约定，首先应当承担的是民事责任，若保密协议约定了行政责任和刑事责任的，也应当依法承担。民事责任民事责任又可以分为违约责任和侵权责任。雇员违反保密协议很可能同时侵犯了用人单位的商业秘密，给用人单位造成了实际损失。因此，用人单位可以要求雇员承担违反保密协议约定的违约责任，如果保密协议中约定了违约金，则用人单位可以要求违约的雇员支付违约金。如果违约金畸高或者畸低，双方可以要求适当降低或提高。用人单位也可以选择要求雇员承担赔偿损失的侵权责任。但违约责任与侵权责任不能同时适用，用人单位只能从中选择一种。行政责任根据《反不正当竞争法》的规定，工商行政管理机关有权依法责令停止违法行为，并可以根据情节处以一万元以上，二十万元以下的罚款。同时工商管理机关还可以责令侵权人将载有商业秘密的图纸、软件及其他有关资料返还权利人或销毁。刑事责任根据《刑法》的有关规定，如有以下行为，并且给商业秘密的权利人造成重大损失的，处3年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金，造成特别严重后果的，除3年以上7年以下有期徒刑，并处罚金。

保密协议是协议当事人之间就一方告知另一方的书面或口头信息，约定不得向任何第三方披露该等信息的协议。如果员工违反保密协议的，用人单位可以要求其承担违约责任。构成犯罪的，可以报案处理。