一是及时查清事实，在查封、扣押法定期限内作出处理决定。行政机关办理行政案件并采取查封、扣押强制措施会涉及两个期限，一个是办案期限，一个是查封、扣押期限。行政机关应当尽可能在查封、扣押期限内作出是否给予行政处罚等决定，来不及作出的，应当依法解除查封、扣押。

二是对违法事实清楚，依法应当没收的非法财物予以没收；

三是对法律、行政法规规定应当销毁的，依法销毁。

四是对于当事人没有违法行为、所查封扣押财物与违法行为无关等应当解除查封、扣押的，应作出解除查封、扣押决定，立即退还财物。

相关法律知识：

《中华人民共和国行政强制法》中有关内容的规定

第六十二条违反本法规定，行政机关有下列情形之一的，由上级行政机关或者有关部门责令改正，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分：

(一)扩大查封、扣押、冻结范围的；

(二)使用或者损毁查封、扣押场所、设施或者财物的；

(三)在查封、扣押法定期间不作出处理决定或者未依法及时解除查封、扣押的；

(四)在冻结存款、汇款法定期间不作出处理决定或者未依法及时解除冻结的。

第六十三条行政机关将查封、扣押的财物或者划拨的存款、汇款以及拍卖和依法处理所得的款项，截留、私分或者变相私分的，由财政部门或者有关部门予以追缴；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予记大过、降级、撤职或者开除的处分。

行政机关工作人员利用职务上的便利，将查封、扣押的场所、设施或者财物据为己有的，由上级行政机关或者有关部门责令改正，依法给予记大过、降级、撤职或者开除的处分。

第六十四条行政机关及其工作人员利用行政强制权为单位或者个人谋取利益的，由上级行政机关或者有关部门责令改正，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。

第六十五条违反本法规定，金融机构有下列行为之一的，由金融业监督管理机构责令改正，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分：

(一)在冻结前向当事人泄露信息的；

(二)对应当立即冻结、划拨的存款、汇款不冻结或者不划拨，致使存款、汇款转移的；

(三)将不应当冻结、划拨的存款、汇款予以冻结或者划拨的；

(四)未及时解除冻结存款、汇款的。

第六十六条违反本法规定，金融机构将款项划入国库或者财政专户以外的其他账户的，由金融业监督管理机构责令改正，并处以违法划拨款项二倍的罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。

违反本法规定，行政机关、人民法院指令金融机构将款项划入国库或者财政专户以外的其他账户的，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。