依据刑事诉讼法司法解释的规定，对证人进行保护的案件包括黑社会性质罪、毒品犯罪案件、国家安全等四类。

《最高人民法院关于适用《中华人民共和国刑事诉讼法》的解释》

第二百零五条公诉人、当事人或者辩护人、诉讼代理人对证人证言有异议，且该证人证言对定罪量刑有重大影响，或者对鉴定意见有异议，申请法庭通知证人、鉴定人出庭作证，人民法院认为有必要的，应当通知证人、鉴定人出庭;无法通知或者证人、鉴定人拒绝出庭的，应当及时告知申请人。

第二百零七条证人出庭作证所支出的交通、住宿、就餐等费用，人民法院应当给予补助。

第二百零九条审判危害国家安全犯罪、恐怖活动犯罪、黑社会性质的组织犯罪、毒品犯罪等案件，证人、鉴定人、被害人因出庭作证，本人或者其近亲属的人身安全面临危险的，人民法院应当采取不公开其真实姓名、住址和工作单位等个人信息，或者不暴露其外貌、真实声音等保护措施。

审判期间，证人、鉴定人、被害人提出保护请求的，人民法院应当立即审查;认为确有保护必要的，应当及时决定采取相应保护措施。

一、怎样保护证人的安全

保障证人的安全，是使证人能解除后顾之忧，充分、客观地提供证据，认真履行作证义务，如实反映案件的真实情况的重要条件。司法实践中，证人不愿作证、不敢作证或不如实作证，办案人员取证难，其中很重要的原因就是证人的安全得不到保证。犯罪嫌疑人、被告人或其亲属，对证人进行威胁、侮辱、殴打、打击报复，甚至杀害等严重威胁证人的人身、财产安全的现象时有发生。这不仅给证人的人身、财产造成损失，也严重地影响了司法人员办理案件，影响了诉讼活动的顺利进行。为了保证证人如实地提供自己所知道的案件情况，保证办案人员顺利地调查取证，人民法院、人民检察院和公安机关应当保障证人及其近亲属的安全，特别是人身、财产的安全。这是人民法院、人民检察院和公安机关的法定义务。

在人民法院、人民检察院和公安机关的办案人员调查取证中，应当想办法保证证人的安全。如询问证人应在安全可靠的地方，尽量不让犯罪嫌疑人、被告人及他们的亲属知道。发现证人及其近亲属可能因作证有危险时，应当及时采取保护性的措施，如及时拘捕犯罪嫌疑人、被告人，帮助证人转移到安全的地方。在侦查阶段，应当为证人及其近亲属作证保守秘密等。对威胁、侮辱、殴打或者打击报复证人或其近亲属的，应当根据情况追究其法律责任。对构成犯罪的，应当依照法律的规定追究刑事责任;对情节轻微，不够刑事处罚的，应当根据治安管理处罚条例的规定给予拘留、罚款、警告等治安处罚。对证人进行“威胁”包括以伤害、杀害、毁坏财产等人身、财产安全的威胁，还包括以揭露隐私、毁坏名誉或利用证人的困难或弱点进行要挟，阻止证人作证、逼迫证人作伪证或者对证人或证人的近亲属进行打击报复。对证人进行“侮辱”包括人身侮辱和人格侮辱。