1.土地使用税和耕地占用税在征税范围上的不同：

(1)城镇土地使用税的征收范围：城市、县城、建制镇和工矿区。不包括农村集体所有的土地。

(2)耕地占用税的征收范围：耕地占用税征税范围包括占用的国家所有和集体所有的耕地。耕地是种植农作物的土地，包括菜地、园地。园地包括花圃、苗圃、茶园、果园、桑园和其他种植经济林木的土地。占用鱼塘及其他农用土地建房或从事其他非农业建设视同占用耕地。占用已开发的滩涂、草场、水面和林地，由省、自治区和直辖市结合情况确定是否征收耕地占用税。在占用之前3年内属于规定范围的耕地或农用土地，也视为耕地。

2.土地使用税和耕地占用税在纳税人上的不同：

(1)城镇土地使用税的纳税人：凡在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的单位和个人;

(2)耕地占用税的纳税人：是占用耕地建房或者从事非农业建设的单位或者个人。

3.土地使用税和耕地占用税在特点上的不同：

(1)城镇土地使用税的特点：1.对占用土地的行为征税。2.征税对象是土地。3.征税范围有所限定。

4.实行差别幅度税额。

(2)耕地占用税的特点：1.兼具资源税与特定行为税的性质。2.采用地区差别税率。3.在占用耕地环节一次性课税。4.税收收入专用于耕地开发与改良。4.土地使用税和耕地占用税在税率上的不同：

(1)城镇土地使用税的税率：1.大城市1.5至30元;2.中等城市1.2至24元;3.小城市0.9至18元;4.县城、建制镇、工矿区0.6元至12元。

(2)耕地占用税的税率：1.人均耕地不超过1亩的地区(以县级行政区域为单位，下同)，每平方米为10元至50元;2.人均耕地超过1亩但不超过2亩的地区，每平方米为8元至40元;3.人均耕地超过2亩但不超过3亩的地区，每平方米为6元至30元;4.人均耕地超过3亩的地区，每平方米为5元至25元。经济特区、经济技术开发区和经济发达且人均耕地特别少的地区，适用税额可以适当提高，但是提高的部分最高不得超过上述规定的当地适用税额的50%5.土地使用税和耕地占用税在计税依据上的不同：

(1)城镇土地使用税的计税依据：以纳税人实际占用的土地面积(平方米)为计税依据

(2)耕地占用税的计税依据：纳税人实际占用的耕地面积为计税依据。以上就是有关耕地占用税和土地使用税的区别，在司法实践中，应当严格按照上述情况来进行区分处理，特别是对于不同地区的耕地占有税和土地使用税，因经济发展水平的不同和居民消费能力的差异，也是有所区别的，具体情况由土地管理部门认定。