非婚生子女的抚养权由父母双方协商处理，协商不成的，法院按照以下原则进行判决：

1．不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。

2．已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。

3．子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。

夫妻离婚有两个孩子怎么判？

夫妻离婚有两个孩子的判定如下：

1、夫妻之间进行协商：

（1）如果双方可以就孩子抚养协商一致，按照双方当事人的意思出具判决书；

（2）如果双方不能就孩子抚养协商一致，法院会按照一人抚养一个子女的原则进行判决；

2、判决抚养的时候法院会参考孩子的年龄，性别等因素进行判决；

3、两周岁以内的子女：

原则上女方抚养，父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许；

4、两周岁到十周岁之间的子女：

法院会按照有利子女成长的原则判决；

5、十周岁以上的子女：

可以征求孩子意见，父母双方对十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见；

6、母方有下列情形的，可随父方生活：

（1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的；

（2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的；

（3）因其他原因，子女确无法随母方生活的；

7、在有利于保护子女利益的前提下：

父母双方协议轮流抚养子女的，可行准许。

法律依据：《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。

《民法典》第一千零八十四条，父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。