据国家税务总局《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》公告的规定，个人转让股权以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按财产转让所得缴纳个人所得税。股权转让收入应当按照公平交易原则确定。申报的股权转让收入低于股权对应的净资产份额的，视为股权转让收入明显偏低。被投资企业的土地使用权、房屋、房地产企业未销售房产、知识产权、探矿权、采矿权、股权等资产占企业总资产比例超过20％的，主管税务机关可参照纳税人提供的具有法定资质的中介机构出具的资产评估报告核定股权转让收入。因此，若未按公平交易原则确认股权转让收入，被投资企业相关资产比重超过20％，则可以通过资产评估报告来核定股权转让收入。

一、计税依据明显偏低且无正当理由的判定方法

1、符合下列情形之一且无正当理由的，可视为计税依据明显偏低：

(1)申报的股权转让价格低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的；

(2)申报的股权转让价格低于对应的净资产份额的；

(3)申报的股权转让价格低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让价格的；

(4)申报的股权转让价格低于相同或类似条件下同类行业的企业股权转让价格的；

(5)经主管税务机关认定的其他情形。

2、本条第一项所称正当理由，是指以下情形：

(1)所投资企业连续三年以上(含三年)亏损；

(2)因国家政策调整的原因而低价转让股权；

(3)将股权转让给配偶、父母、子女、祖父母、外祖父母、孙子女、外孙子女、兄弟姐妹以及对转让人承担直接抚养或者赡养义务的抚养人或者赡养人；

(4)经主管税务机关认定的其他合理情形。

3、对申报的计税依据明显偏低且无正当理由的，可采取以下核定方法：

(1)参照每股净资产或纳税人享有的股权比例所对应的净资产份额核定股权转让收入。对知识产权、土地使用权、房屋、探矿权、采矿权、股权等合计占资产总额比例达50%以上的企业，净资产额须经中介机构评估核实。

(2)参照相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让价格核定股权转让收入。

(3)参照相同或类似条件下同类行业的企业股权转让价格核定股权转让收入。

(4)纳税人对主管税务机关采取的上述核定方法有异议的，应当提供相关证据，主管税务机关认定属实后，可采取其他合理的核定方法。

二、企业连续三年亏损,股权转让需要交个税吗

股权转让亏损需要交个税。

个人转让股权需按“财产转让所得”缴纳个人所得税，这与企业的盈利或亏损无关；所以应当依照规定缴纳个税。

如果股权是企业的，扣除以前年度亏损仍有应纳税所得额的，需要交纳企业所得税。

如果是个人的，没有不交税的规定，因为亏损企业太多了，容易造假。

该股权交易如包括帐面未分配利润，则视同股息分配。因此股权让要交个人所得税，不管盈亏。

根据《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》第四条规定：个人转让股权，以股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按“财产转让所得”缴纳个人所得税。合理费用是指股权转让时按照规定支付的有关税费。