农村合作医疗和社保的报销比例高。具体如下：

1、新农合的报销比例没有社保报销比例高，新农合和社保都是我国基本医疗保障制度的一部分，还有一个城镇居民医保，覆盖全体城乡居民。住院的针对不同对象、筹集基金标准不同、经费来源、补偿标准不同，赔付比例也有差异；

2、新农合针对的承保人群一般是农村务农人员，在保费上没有职工社保或城镇职工医保的缴纳费率高，所以一般职员社保或者城镇居民医保的报销比例比新农合高；

3、但是无论哪一类人员，门诊、急诊大额医疗费支付的费用最高限额是两万元。一般城镇居民医疗保险报销比例较高，城镇居民医疗保险的报销比例高达85％，新农合的报销比例根据不同医院的等级报销比例在10％－80％之间。

法律依据：《中华人民共和国社会保险法》第四条

中华人民共和国境内的用人单位和个人依法缴纳社会保险费，有权查询缴费记录、个人权益记录，要求社会保险经办机构提供社会保险咨询等相关服务。

个人依法享受社会保险待遇，有权监督本单位为其缴费情况。

第十条

职工应当参加基本养老保险，由用人单位和职工共同缴纳基本养老保险费。

无雇工的个体工商户、未在用人单位参加基本养老保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加基本养老保险，由个人缴纳基本养老保险费。

公务员和参照公务员法管理的工作人员养老保险的办法由国务院规定。

灵活就业人员社保报销比例

灵活就业人员医保参照的是城镇职工医保，享受待遇也是城镇职工医保一样，达到退休年龄且满足足够的缴费年限即可享受退休待遇，即退休后无需缴费也可以享受医保待遇。灵活就业人员的医保和职工医保报销比例及起付线没什么区别，唯一不同的是在职职工有医保个人账户，而灵活就业人员没有。自由职业者，个体户参保，可以选择只建统筹基金，不建个人帐户，按当地上年度月平均工资的4．2％缴纳基本医疗保险费；也可以选择按当地上年度月平均工资的8％缴纳，建立个人帐户！职工参加医疗保险是单位承担6％，个人承担2％；医疗报销若建立个人帐户，报销都一样。