外经证不核销有影响，可能会被罚款。外经证一般是在完税后核销，票据使用单位使用完票据后，票据监管机关对票据的使用情况进行查验，在票据的保管期限满了之后，再由监管机构核准销毁。在纳税人外出经营活动结束后，应该持查验后的外管证和项目续开的外管证，回到主管机构办理核销的手续，需要到纳税人的主管税务机关进行督促核销外经证。

外经证办理流程

外经证全称为外出经营活动税收管理证明，办理流程如下：

1、受理审核：查验纳税人出示的证件是否有效；《外出经营活动税收管理证明》填写是否完整、逻辑关系是否正确，有关印章是否齐全；纸质资料不全或者填写内容不符合规定的，应当场一次性告知纳税人补正或重新填报。

2、核准：审核无误的，核准纳税人的外出经营申请，录入系统，制作《外出经营活动税收管理证明》签章后交付纳税人。

3、资料归档：需要纳税人提供资料为《外出经营活动税收管理证明》、《税务登记证》。

法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第二十一条

从事生产、经营的纳税人到外县（市）临时从事生产、经营活动的，应当持税务登记证副本和所在地税务机关填开的外出经营活动税收管理证明，向营业地税务机关报验登记，接受税务管理。

从事生产、经营的纳税人外出经营，在同一地累计超过180天的，应当在营业地办理税务登记手续。

第二十四条

从事生产、经营的纳税人应当自领取税务登记证件之日起15日内，将其财务、会计制度或者财务、会计处理办法报送主管税务机关备案。

纳税人使用计算机记账的，应当在使用前将会计电算化系统的会计核算软件、使用说明书及有关资料报送主管税务机关备案。

纳税人建立的会计电算化系统应当符合国家有关规定，并能正确、完整核算其收入或者所得。

《中华人民共和国税收征收管理法》第六十二条纳税人未按照规定的期限办理纳税申报和报送纳税资料的，或者扣缴义务人未按照规定的期限向税务机关报送代扣代缴、代收代缴税款报告表和有关资料的，由税务机关责令限期改正，可以处二千元以下的罚款；情节严重的，可以处二千元以上一万元以下的罚款。