建筑工程合同款应当在签订施工合同时确定。工程竣工后双方就工程款发生纠纷的，可以私下协商调解。协商调解不成的，可以诉诸法院让法院裁决。根据施工合同司法解释第二十六条的规定，实际施工人以转包人和非法分包人为被告起诉的，人民法院应当依法受理工程挂靠人与被挂靠人之间返还工程款的纠纷。实际施工人以发包人为被告主张权利的，人民法院可以增加转包人或者非法分包人为本案当事人。发包人只在欠付工程价款范围内对实际施工人承担责任。因此，在挂靠人未足额结算工程款的情况下，挂靠人作为实际施工人，可以以挂靠人和发包人为共同被告提起民事诉讼，发包人有证明其是否已付清工程款的举证责任。施工合同司法解释第二十五条明确规定，因建设工程质量发生纠纷的，发包人可以以总承包人、分包人和实际施工人为共同被告提起诉讼。因工程质量发生纠纷时，发包人可以挂靠人和被挂靠人为共同被告提起诉讼，要求两者承担连带责任。

签订挂靠公司协议需要注意什么

挂靠协议中甲方需要的注意事项：

1、协议期内在未得到乙方书面认可的情况下甲方不得将乙方资格证书用到其他的企业，否则即视为违约；不得作出有损于乙方利益的行为。因甲方原因给乙方造成行政、法律后果和经济损失的由甲方承担全部责任。

2、如遇证书年检等需要乙方到位，甲方应提前通知乙方，乙方需支持配合由此引发的合理费用（含来回路费、生活住宿费等）由甲方负责凭＊＊＊全额报销。

3、甲方保证乙方的个人信息秘密

4、甲方承诺将乙方的资格证书仅用于本企业资质升级或资质年检使用。如用于其它事项须先征得乙方同意费用及各事项应另行协商协商致一再另行签订协议约束。若甲方违约使用所造成的一切后果由甲方承担并赔偿乙方因此造成的全部损失。因甲方违约使用乙方的园林工程师资格证书造成的一切后果乙方不负任何行政、法律、经济等一切责任。

5、履行期间甲方办理资质升级或招投标时需乙方提供身份证等相关证件原件时乙方应积极配合甲方办理原件核对。

《中华人民共和国劳动合同法》。