1、对于刑事自诉案件，证据不足的，法院不应受理立案申请。对已经立案，经审查缺乏证据的自诉案件，被害人提不出补充证据的，法院应当说服其撤回起诉或者裁定驳回起诉。2、被害人有证据证明的轻微刑事案件，对于其中证据不足、可由公安机关受理的，或者认为对被告人可能判处三年有期徒刑以上刑罚的，应当移送公安机关立案侦查。经过公安机关侦查后，涉嫌犯罪的，依法提起公诉，若未构成犯罪的，可由公安机关等行政部门处予相应的行政处罚后，由被害人提起民事诉讼追偿。3、对于已经立案，由于缺乏罪证，被害人撤回自诉或被驳回自诉后又提出了新的证据足以证明被告人有罪的，人民法院应当受理。4、人民法院裁定驳回自诉或被害人提出撤诉，经准许后，整个诉讼就结束了。如果被害人对人民法院裁定驳回自诉不服的，被害人有权提出上诉。5、事实上，即便法院受理也审理了刑事自诉案件，但如果证据不足的，法院也会依法判决无罪的。

被告证据不足的案子应怎么处理？

根据法律规定，在刑事诉讼中，公安机关侦查终结的案件，一律由人民检察院审查决定是否起诉。人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。如果被不起诉人在押，应当立即释放。

《刑事诉讼法》第七十八条逮捕犯罪嫌疑人、被告人，必须经过人民检察院批准或者人民法院决定，由公安机关执行。第七十九条对有证据证明有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚的犯罪嫌疑人、被告人，采取取保候审尚不足以防止发生下列社会危险性的，应当予以逮捕：（一）可能实施新的犯罪的；（二）有危害国家安全、公共安全或者社会秩序的现实危险的；（三）可能毁灭、伪造证据，干扰证人作证或者串供的；（四）可能对被害人、举报人、控告人实施打击报复的；（五）企图自杀或者逃跑的。对有证据证明有犯罪事实，可能判处十年有期徒刑以上刑罚的，或者有证据证明有犯罪事实，可能判处徒刑以上刑罚，曾经故意犯罪或者身份不明的，应当予以逮捕。被取保候审、监视居住的犯罪嫌疑人、被告人违反取保候审、监视居住规定，情节严重的，可以予以逮捕。第九十二条人民法院、人民检察院对于各自决定逮捕的人，公安机关对于经人民检察院批准逮捕的人，都必须在逮捕后的二十四小时以内进行讯问。在发现不应当逮捕的时候，必须立即释放，发给释放证明。《刑事诉讼法》第一百六十一条规定：在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。