注册分公司的主要注意事项有：

(一)、分公司的申请由母公司设立，不涉及注入资助资本。分公司的经营资金由总公司共计，总公司的资产对分公司的债务和债务承担法律责任；

(二)、分公司名称核准只需在总公司名称后加分公司名称即可；

(三)、分公司财务核算。同一地区分公司成立后，会计方式一般由税务机关核定为非独立核算，不具备开具发票的资格。外国公司分公司可以向税务机关申请独立核算或非独立核算，并可以申请增值税资格；

(四)、分公司不独立承担民事责任，由总公司承担，没有自己的章程，没有董事会形成公司的经营决策和业务执行机关。

一、分公司如何纳税，纳税标准是怎样的

分公司缴税办理流程：

分公司的流转税，必须在当地的税务机关核算缴纳，这个是流转税的基本原则。

也就是到地税申报缴纳。现在基本上所有的城市国税地税申报都是网上申报，未开通网上申报的公司，可以凭借税务登记证（正本副本）营业执照，基本行开户许可证，基本行开户行信息等证件，到当地税务机关申请网上申报纳税。

如果分公司跟总公司之间是非独立核算，那么，分公司的所有税种的申报，都必须由总公司汇总，由总公司申报。

非独立核算的分公司仅仅只是总公司的一个分支机构，相当于一个部门。

一般情况下，如果分公司是个独立核算的群体，既有营业收入，又有支出，分公司虽小，但是五脏俱全，这种情况下的分公司，从财政考核上考虑，相信很多企业领导人都会做出一个决定，总分公司财政独立，个子独立核算。

独立核算下的分公司，需要向当地税务机关申报纳税。

在分公司成立之初，就可以凭借当即工商部门审批下来的分公司营业执照，总公司的营业执照等相关证件，到当地银行办理分公司基本行开户。

如果总分公司不在一个地级市，这时候的企业所得税的申报，则需根据跨区经营所得税申报原则进行申报，按照总公司所在地国税部门核准的分配比例，总公司分公司分别各自向当地所得税申报主管部门申报缴纳。

关于企业所得税的申报问题，如果总分公司在同一个地级市以内，那么无论总分公司是否独立核算，均由总公司汇总申报即可。

二、总公司和分公司之间的关系

（一）分公司与总公司的关系虽然同子公司与母公司的关系有些类似。但分公司的法律地位与子公司完全不同，它没有独立的法律地位。

（二）分公司是总公司下属的直接从事业务经营活动的分支机构或附属机构。虽然分公司有公司字样，但它不是真正意义上的公司。因为分公司不具有企业法人资格，不具有独立的法律地位，不独立承担民事责任。

（三）分公司的特征具体表现为：

1、分公司没有自己的独立财产，其实际占有、使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。

2、分公司不独立承担民事责任。

3、分公司不是公司，它的设立不须依照公司设立程序，只要在履行简单地登记和营业手续后即可成立。

4、分公司没有自己的章程，没有董事会等形式的公司经营决策和业务执行机关。

5、分公司名称，只要在总公司名称后加上分公司字样即可。分公司不具有企业法人资格，其民事责任由总公司承担。虽有公司字样但并非真正意义上的公司，无自己的章程，公司名称只要在总公司名称后加上分公司字样即可。