一、公司搬迁员工赔偿金要扣税吗合法吗

公司赔偿金是要交税的。个人因解除和用人单位的劳动关系，而取得的一次性的补偿收入，收入低于当地职工的上年度平均工资的三倍的部分，免征个人所得税。

超出部分依据相关规定，计算征收个人所得税，考虑到失业人员一次性经济补偿收入数额较大，而且被辞退人员在一段时间之内可能没有固定收入，所以是可以不用缴纳的。

二、员工赔偿金仲裁期限

劳动合同补偿金和赔偿金争议申请仲裁的时效是1年。

《劳动争议调解仲裁法》第二十七条劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。

前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。

因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。

三、员工赔偿金仲裁流程

员工仲裁理赔流程：

1．劳动仲裁程序申请仲裁委员会处理劳动争议案件必须由当事人的申请，否则，仲裁委员会无权仲裁该案件。

2．劳动仲裁审查受理。

3．仲裁准备：

（1）组成仲裁庭。

（2）对应当回避的仲裁委员会的成员、被指定的仲裁员、仲裁庭的书记员、鉴定人、勘验人和翻译人员等，作出回避决定。

（3）调查取证。仲裁庭人员应认真阅当事人的申诉和答辩材料，调查、收集证据，查明争议事实。对于需要勘验或鉴定的问题，应提交法定部门进行，没有法定部门的，由仲裁员会委托有关部门进行。各地仲裁委员会之间可以互相委托调查，受委托方应当在委托方要求的期限内完成调查。因故不能完成的，应当在要求期限内函告委托方仲裁委员会。

（4）拟定仲裁方案。

《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》：第三章　仲裁 第二节　申请和受理　　第二十七条　【仲裁时效】劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。\n前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。\n因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。\n劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。