员工辞职应当办理的手续有：

1、为从事有职业病危害作业的员工做健康检查。

2、办理工作交接。

3、归还公司财物、文件资料及清偿债务。

4、退还员工证件及结清工资。

5、如是公司提出解除劳动合同的，按照劳动合同法的规定向员工支付经济补偿金。

6、签订竞业禁止协议。对于公司认为需要签订竞业禁止协议的则在解除劳动合同协议中明确员工的相应义务。

7、出具解除或者终止劳动合同的证明。

8、办理档案和社会保险关系转移手续。

一、公司辞退员工流程

1、通知被辞退人员相关情况，并出具解除劳动合同通知书；

如果通知被辞退人员来办理相应手续不予理睬的，可以先向其邮寄“关于限期回公司办理解除劳动合同手续的通知”（时间为一周内），待其签收后仍不理睬时，即可按照相关法律的规定，依法解除与其的劳动合同，同时按照第五十条“用人单位应当在解除或者终止劳动合同时出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。劳动者应当按照双方约定，办理工作交接。用人单位依照本法有关规定应当向劳动者支付经济补偿的，在办结工作交接时支付。用人单位对已经解除或者终止的劳动合同的文本，至少保存二年备查。”的规定，办理相关手续转移。对于因旷工辞退员工这一事件无需对社会进行公示，但建议在企业内部召开职工大会向全体员工声明。

2、按离职要求办理离职手续，向劳动者出具离职证明、住房公积金等相关手续，结清工资；

离职证明，是用人单位与劳动者解除劳动关系的书面证明，是用人单位与劳动者解除劳动关系后必须出具的一份书面材料。人事部应以必须的格式写明离职员工的受雇日期、职位及其离职原因以及开证明的日期，且必须盖单位公章而且必须是原章，还应注意的是，离职证明复印无效。

住房公积金可参考《住房公积金管理条例》的规定：单位与职工终止劳动关系的，单位应当自劳动关系终止之日起30日内到住房公积金管理中心办理变更登记，并持住房公积金管理中心的审核文件，到受委托银行办理职工住房公积金账户转移或者封存手续。

3、给劳动者办理社保停缴等手续，并在人事台帐上进行备注。

应注意的是，如无法通知本人选择快递邮至员工家中的通知方式应当将快递单据、还有辞退他的告知书一块拍照留存。还保留其考勤情况等作为证据，以防以后出现其他情况。

对于公务员存在旷工的行为，显然是构成了违反公务员法的相关情况，在司法实践中，应当严格按照法律规定来进行处理，特别是公务人员的处罚情况，一般还需要按照组织程序来进行处理，但对于符合辞退条件的，应当进行处理。

二、协议解除劳动合同有哪些具体程序

协议解除劳动合同程序具体如下：1、解除劳动合同的提出：公司及员工均有权提出解除劳动合同；2、达成一致：双方在自愿、平等协商的基础上达成一致意见；3、工作交接：用人部门安排员工依照相关规定办理工作交接；4、结算薪资和经济补偿：在员工办理完毕工作交接后，财务科应当结算并支付该员工的薪资；如果是公司提出解除合同，还应当结算并支付该员工的经济补偿；5、完成上述流程后，劳动合同按双方约定解除；6、在解除劳动合同时，公司人事部门出具解除劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续；7、对解除的劳动合同的文本原稿及原电子档案进行备案，至少保存二年备查。