如检察院立案，代表该案已经进入到审查起诉阶段，下一步将会是法院审理。检察院是代表国家行使起诉权，在犯罪行为被公安机关立案侦察后，公安机关认为该行为符合犯罪的基本特征，构成犯罪，则会将该案移交检察院进行起诉，检察院进行调查，最终做出起诉意见书，向人民法院提起公诉。

检察院立案侦查后什么程序

检察院批捕时，刑事案件是处于侦查阶段，之后还要经过审查起诉阶段，然后再是审判阶段。

检察院接到侦查机关移送的案件以后，案件进入到审查起诉阶段。

在这一阶段，检察院会对《起诉意见书》以及全部案卷材料和证据进行全面审查，讯问犯罪嫌疑人，听取被害人的意见，听取犯罪嫌疑人、被害人委托人的意见，调查核实其他证据，认为案件事实不清，证据不足，需要对案件作进一步侦查时，可以决定退回侦查机关补充侦查。

除上述退回补充侦查，由侦查机关作出撤消案件处理的以外，检察院审查后，在案件事实已经查清，证据确实、充分的前提下，会有两种处理方式：

一是对于依法应当追究犯罪嫌疑人刑事责任的，向人民法院起诉；

二是对于依法不应追究刑事责任，或者依法不需要判处刑罚、免除处罚的，或者补充侦查的案件证据仍然不足的，不将案件交付人民法院审判，即不起诉。

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》

第八十条

逮捕犯罪嫌疑人、被告人，必须经过人民检察院批准或者人民法院决定，由公安机关执行。

第九十四条

人民法院、人民检察院对于各自决定逮捕的人，公安机关对于经人民检察院批准逮捕的人，都必须在逮捕后的二十四小时以内进行讯问。在发现不应当逮捕的时候，必须立即释放，发给释放证明。

第一百七十六条

人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定，按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉，并将案卷材料、证据移送人民法院。

犯罪嫌疑人认罪认罚的，人民检察院应当就主刑、附加刑、是否适用缓刑等提出量刑建议，并随案移送认罪认罚具结书等材料。

第一百七十七条

犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。

对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。

人民检察院决定不起诉的案件，应当同时对侦查中查封、扣押、冻结的财物解除查封、扣押、冻结。对被不起诉人需要给予行政处罚、处分或者需要没收其违法所得的，人民检察院应当提出检察意见，移送有关主管机关处理。有关主管机关应当将处理结果及时通知人民检察院。

综合上面所说的，检察院只要对案件进行立案侦查之后，那么就会按法律规定的流程来进行办理，但前提也是必须要有证据来证明案件的事实情况；这样才能合法的进行下去，所以，任何案件都是有处理流程的，但前提也不能超过法律规定的最高期限。

《刑事诉讼法》第三条对刑事案件的侦查、拘留、执行逮捕、预审，由公安机关负责。检察、批准逮捕、检察机关直接受理的案件的侦查、提起公诉，由人民检察院负责。审判由人民法院负责。除法律特别规定的以外，其他任何机关、团体和个人都无权行使这些权力。人民法院、人民检察院和公安机关进行刑事诉讼，必须严格遵守本法和其他法律的有关规定。

第七条人民法院、人民检察院和公安机关进行刑事诉讼，应当分工负责，互相配合，互相制约，以保证准确有效地执行法律。