1、当事人意思自治原则

仲裁条款就其实质而言，是合同上的一项安排，是当事人之间共同的意思表示，它是当事人之间在订立合同时达成的将合同在履行中可能发生的争议交由仲裁解决，而不是诉诸法院的这一共同的意思表示。就此意思表示而言，应该说是真实的，即使存在欺诈行为，也不影响仲裁协议的独立性;即使是不真实的意思表示，也不影响仲裁协议的独立性，仲裁条款仍可独立于该自始无效的合同而独立存在。这也就是说，当事人意思自治原则排除了合同由于通过欺诈方式或者不真实意愿订立而被宣布为自始无效的情形，成为仲裁协议独立于主合同的前提。

2、仲裁条款的特殊性

仲裁条款的特殊性主要是指：这些其他条款所规定的，是当事人之间相互承担的权利与义务，对于这些条款的违反，其后果是直接产生损害赔偿问题;而仲裁条款所规定的是当事人双方共同承担的权利与义务，对仲裁条款的违反并不直接产生损害赔偿的问题，而是对此条款的强制执行。之所以说仲裁条款的特殊性是仲裁协议独立的理由，原因在于仲裁条款的特殊性决定了仲裁协议的独立性。如果仲裁协议不能独立，那么仲裁条款就不能强制执行;反之，仲裁条款不能强制执行，那么就不存在仲裁协议的独立性问题，而仲裁条款的特殊性就特殊在其可以强制执行，所以仲裁协议因此而独立。

3、国家政策上的支持和法律上的认可

伴随经济的发展，近年来，各国对仲裁政策都加以放宽，且越来越倾向于鼓励仲裁协议独立。在司法实践上，各国几乎一致的都承认了仲裁协议的独立性，以至于进一步通过立法明确规定了仲裁协议的独立性，如此，国家政策上的支持和法律上的认可更直接的确立了仲裁协议的独立性，理所当然的成为其理论依据。

仲裁协议独立性的概述

仲裁协议的独立性，又称为仲裁协议的“可分性”或“自治性”。其基本含义是指，尽管仲裁条款是主合同中的一个条款，但此条款与它所依据的合同是两个互相独立的合同。如果争议涉及主合同的存在与否或其有效性问题，或者即使主合同无效或失效，仲裁条款作为双方当事人之间约定的解决合同争议的条款，仍可独立存在，并不由于主合同无效或失效而当然无效或失效。但是，仲裁协议的独立性并不是绝对的，而是一种相对特殊的独立性。说它是一种相对特殊的独立性是因为：第一，它因主合同的订立而订立，随着主合同的完全履行而终结;第二，一旦成立，它就从效力上独立于主合同的效力。说它的独立性不是绝对的，是因为它也有局限的一面：如果存在着影响主合同和主合同中的仲裁条款有效性的理由，那么仲裁协议可能不起作用或无效。因此，仲裁协议并不总是可以存续的。