在司法实践中，商业秘密的损失计算大致分为以下几种：

1、以商业秘密权利人因侵权行为遭受的损失作为定罪量刑和实际赔偿的依据。

商业秘密权利人可计算的财产、收入方面的损失应全部作为损失的数额。这里既包括权利人本身的收入，也包括权利人预期的若干年内收益。主要考虑的因素有：商业秘密研制开发的成本、商业秘密的成熟程度、商业秘密的利用周期长短及其是否可以重复利用，以及商业秘密的使用和转让、市场的供求状况等。

2、以侵权人因侵权行为获得的利益作为损失和赔偿额。

这种损失的计算以侵权人未再向第三人披露、转让和不为其他公众所知为前提。对于非法将商业秘密出卖给他人的，以其非法出卖收入为损失额；违法使用商业秘密进行生产经营活动的，以其因此获得或增加的利润为损失额。如果侵权人的行为属于间接使用（如利用跳槽员工带来的原单位的技术信息和经营信息等)，以其产生的效益为损失及赔偿额。

3、以不低于商业秘密使用许可的合理使用费为损失及赔偿额。

当上述两种方法计算不便时，可采用这种弥补性方法来计算损失额。这种方法是假定侵权方在正常情况下取得权利人商业秘密的许可使用时，其许可费用应该是多少，再推定该数额为损失额，但这并不意味着侵权人就此取得了该商业秘密的合法使用权。这里尤其值得一提的是，刑法及司法解释并未就重大损失和特别严重后果作出规定和说明。司法实践中，重大损失一般是指给权利人的生产经营活动造成的经济损失或丧失竞争优势、竞争能力甚至竞争资格等；特别严重后果是指给权利人的生产经营活动造成特别重大的经济损失，甚至导致企业清算、破产等情况。由于本罪是结果犯，如无重大损失则不构成犯罪，因此，从罪刑法定及罪刑相适应原则出发，立法机关或司法机关应当对此作出明确的规定或解释，以便实际操作。

有哪些保护商业秘密的途径？

第一、向仲裁机构申请仲裁解决。

如果此前企业与侵权人之间签订了商业秘密保护合同，并且双方自愿达成仲裁协议的，可依据《仲裁法》向双方仲裁协议中约定的仲裁机构申请仲裁。

第二、向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。

企业与职工（包括离职的)之间因商业秘密引起的纠纷或签订劳动合同的职工，期限未满，擅自跳槽，带走企业商业秘密，侵犯企业利益的，企业可依据《劳动争议调解仲裁法》向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是必经程序。

第三、向工商行政管理部门投诉。

《反不正当竞争法》第25条规定了相应的行政责任，即对侵犯商业秘密的行为，监督检查部门应当责令停止违法行为，可以根据情节处以一万元以上二十万元以下的罚款。企业的商业秘密被侵犯后，可以向县级以上工商机关投诉，并提供商业秘密及侵权行为的有关证据。

第四、向人民法院提起民事诉讼。

根据《反不正当竞争法》、《民事诉讼法》等法律规定，企业的商业秘密被侵犯，可以直接向人民法院提起民事诉讼。向人民法院起诉的，要弄清人民法院的管辖范围，一般讲应向被告所住地人民法院或侵权行为地人民法院起诉。订立合同的，应向被告所住地或合同履行地人民法院起诉。

第五、刑事诉讼程序。

侵犯商业秘密行为构成犯罪时，权利人应向公安机关报案，由公安机关立案侦查，侦查终结的案件，移送同级人民检察院。检察院认为事实清楚、证据充分，应该追究刑事责任的，向同级人民法院提起公诉。对于犯罪行为尚未对社会秩序和国家利益造成严重危害的案件，权利人可以自行向法院提起刑事自诉。在刑事公诉或自诉程序中，权利人可以提起附带民事诉讼，要求被告人赔偿自己遭受的损失。