合同纠纷仲裁程序有以下三个步骤：

1、申请和受理

（1）申请，是指一方当事人根据合同仲裁条款或事后达成的仲裁协议，将发生的争议依法请求仲裁委员会进行仲裁的行为。提起仲裁申请是当事人为获得仲裁、解决纠纷的一种请求，是保护自身合法权益的一种手段，也是仲裁机构行使仲裁权的前提。只有当事人提起仲裁申请，仲裁委员会才能受理案件。

（2）受理，是指仲裁机构对当事人的申请进行审查后，认为符合受理条件，决定立案进行仲裁的程序。受理是仲裁程序的开始，是仲裁机构开始行使管辖权的标志。

2、仲裁庭的组成。仲裁机构仲裁案件，不是仲裁委员会直接仲裁，而是通过一定的组织实现的，这个组织称为仲裁庭。根据仲裁法的规定，仲裁庭组成有两种组织形式：

（1）独任仲裁庭，即由一名仲裁员组成的仲裁庭。

（2）合议仲裁庭，即由三名仲裁员组成的仲裁庭。仲裁庭的组织形式由当事人约定，仲裁员由当事人选定或委托仲裁委员会主任指定。

3、开庭和裁决。

（1）开庭是仲裁庭在双方当事人和其他仲裁参与人参加下，对仲裁请求进行实体审理和裁决的活动。开庭是仲裁活动的实质阶段。其目的是查清事实、分清是非、正确适用法律、确认当事人之间的权利义务关系。

（2）裁决是指仲裁庭在实体上对当事人权利义务作出裁断。裁决是仲裁审理的最终程序，一经作出即发生法律效力。

一、合同纠纷的解决方式

一般来说，合同纠纷的解决方式主要有以下四种：

1、协商：合同当事人在友好的基础上，通过相互协商解决纠纷，这是最佳的方式。

2、调解：合同当事人如果不能协商一致，可以要求有关机构调解如，一方或双方是国有企业的，可以要求上级机关进行调解。上级机关应在平等的基础上分清是非进行调解，而不能进行行政干预。当事人还可以要求合同管理机关、仲裁机构、法庭等进行调解。

3、仲裁：合同当事入协商不成，不愿调解的，可根据合同中规定的仲裁条款或双方在纠纷发生后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。

4、诉讼：如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，合同当事人可以将合同纠纷起诉到法院，寻求司法解决。除了上述一般特点之外，有些合同还具有其自愿的特点，如涉外合同纠纷，解决时可能会援引外国法律、而不是中国相关的合同方面的法律。