一、运输合同管辖法院能否约定

依据我国相关法律的规定，运输合同纠纷是可以约定管辖法院的，但只能在运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院之间约定一个管辖法院。

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二十七条，运输合同纠纷管辖，因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。

二、怎样在合同中约定管辖地

合同的司法管辖地一直是当事人的争议之处，这里面既有诉讼成本方面的原因也有其他方面的原因。按照民事诉讼法及其司法解释，合同中可以约定原告所在地、被告所在地、合同履行地、合同签订地法院管辖。为了明确合同的履行地，最高人民法院还进行了一系列的司法解释。

除非约定唯一的管辖法院，任何其他方式的约定均有可能导致管辖的不确定性。原告所在地法院管辖表面上是一种公平的约定，将管辖权授予了权益受损方所在地法院，但违约方完全可以行使诉权以“恶人先告状”的方式提起诉讼争夺管辖权。而被告所在地人民法院管辖则是大家都不希望的，因为“客场作战”会有许多麻烦和不可预料的问题。由于“原告就被告”本身就是管辖的原则之一，除非是为了排斥其他管辖，否则没必要约定。

约定合同签订地法院管辖能够保证管辖的唯一性，在合同中同时约定合同签订地即可做到。而合同履行地法院管辖问题由于诉讼法司法解释的存在，有时根本无需约定，只是在实际操作中控制履行地点并保留证据即可。如果非要约定合同履行地，则有多种隐蔽的表述方法，有时以约定了交货地点的方式替代，有时可约定产品价格包含代办托运费，或约定代办托运费由对方承担等。只要理解了相关法条和司法解释便会有多种方式去设立管辖条款。

三、对约定管辖可以提异议吗

只要约定管辖不违反级别管辖和专属管辖的规定。那么就可以对约定管辖提异议。

根据《民事诉讼法》第三十四条，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。

第十七条基层人民法院管辖第一审民事案件，但本法另有规定的除外。

第十八条中级人民法院管辖下列第一审民事案件：

（一）重大涉外案件

（二）在本辖区有重大影响的案件

（三）最高人民法院确定由中级人民法院管辖的案件

第十九条高级人民法院管辖在本辖区有重大影响的第一审民事案件

第二十条最高人民法院管辖下列第一审民事案件：

（一）在全国有重大影响的案件

（二）认为应当由本院审理的案件