依据我国相关法律的规定，货物运输合同是可以约定管辖的，但约定管辖只能在运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院之间约定。

《中华人民共和国民事诉讼法》

第二十七条运输合同纠纷管辖

因铁路、公路、水上、航空运输和联合运输合同纠纷提起的诉讼，由运输始发地、目的地或者被告住所地人民法院管辖。

一、约定管辖协议必须符合的条件

（1）当事人协议管辖的案件，包括合同或者其他财产权益纠纷。

（2）当事人协议选择管辖法院的范围，包括可以选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖。如果当事人选择了与合同没有实际联系地点的人民法院，该协议无效。合同签订地是指合同双方在书面合同上签字和盖章的地点。例如，广东某厂与黑龙江某厂在北京签订购销合同，北京为合同签订地。标的物所在地是指标的物存放的地点。例如，上海某厂与大同某厂签订的购销合同，合同约定履行地为大同火车站，货物由上海装船运至秦皇岛港时发生纠纷，因货物在秦皇岛港，秦皇岛港为标的物所在地。

（3）必须以书面协议选择管辖，包括书面协议可以采取合同书的形式，包括书面合同中的协议管辖条款，也可以采取信件和数据电文（包括电报、电传、传真、电子数据交换和电子邮件）等可以有形地表现当事人双方协议选择管辖法院意思表示的形式。或者是诉讼前双方当事人达成的管辖协议，口头协议无效。

（4）当事人必须进行确定的、单一的选择。当事人必须在上述五个法院中选择其一。

（5）协议管辖不得违反民事诉讼法关于级别管辖和专属管辖的规定。

二、怎样在合同中约定管辖地

合同的司法管辖地一直是当事人的争议之处，这里面既有诉讼成本方面的原因也有其他方面的原因。按照民事诉讼法及其司法解释，合同中可以约定原告所在地、被告所在地、合同履行地、合同签订地法院管辖。为了明确合同的履行地，最高人民法院还进行了一系列的司法解释。

除非约定唯一的管辖法院，任何其他方式的约定均有可能导致管辖的不确定性。原告所在地法院管辖表面上是一种公平的约定，将管辖权授予了权益受损方所在地法院，但违约方完全可以行使诉权以“恶人先告状”的方式提起诉讼争夺管辖权。而被告所在地人民法院管辖则是大家都不希望的，因为“客场作战”会有许多麻烦和不可预料的问题。由于“原告就被告”本身就是管辖的原则之一，除非是为了排斥其他管辖，否则没必要约定。

约定合同签订地法院管辖能够保证管辖的唯一性，在合同中同时约定合同签订地即可做到。而合同履行地法院管辖问题由于诉讼法司法解释的存在，有时根本无需约定，只是在实际操作中控制履行地点并保留证据即可。如果非要约定合同履行地，则有多种隐蔽的表述方法，有时以约定了交货地点的方式替代，有时可约定产品价格包含代办托运费，或约定代办托运费由对方承担等。只要理解了相关法条和司法解释便会有多种方式去设立管辖条款。