让损害公司利益的小股东退出的方式是：

1、与该小股东达成股权转让协议，购买其股份；

2、如果该小股东未履行出资义务的，经催告后仍不履行的，可以通过股东会或股东大会的决议解除其股东资格。

一、小股东权益的公司法救济

1、允许股东查阅会计账簿，强化了股东知情权。

公司对查阅股东的不正当目的承担举证责任。倘若公司无端怀疑，无故拒绝提供查阅，股东可以请求人民法院要求公司提供查阅。

2、明确赋予股东对公司经营者的索赔权。

董事、高级管理人员违反法律、行政法规或者公司章程的规定，损害股东利益的，股东可以向人民法院提起诉讼。

3、有限责任公司股东的股权转让自由更具弹性和效率。

股东向股东之外的第三人转让股权时不需履行股东会的决议程序，只需股东就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意。

4、首次确认股东的退股权。

5、股东有权就存在瑕疵的股东会决议提起无效确认之诉与撤销之诉。

6、引入了股东的累积投票权。

股东大会选举董事、监事，可以依照公司章程的规定或者股东大会的决议，实行累积投票制。

7、规定小股东的股东代表诉讼提起权。

二、小股东保护自身利益的方法有哪些

小股东保护自身利益的方法如下：小股东有知情权。股东有权了解公司经营状况、财务状况等信息，包括查阅、复制公司章程、股东会会议记录、董事会决议、监事会决议和财务会计报告，股东派生诉讼。当公司的合法权益受到他人的侵害，特别是有控制权的股东、母公司、董事和高级管理人员的侵害，公司怠于行使诉讼权利时，符合法定条件的股东可以以自己的名义为公司的利益对侵权人提起诉讼，追究其法律责任。股东有权要求股利分配。当公司有可分配的盈余时，小股东可以要求按照自己的持股比例分配股利。小股东行使退股权。有下列情形之一的，股东可以提起收购股份的诉讼：一、公司连续五年不向股东分配利润，公司连续五年盈利，符合本法规定的利润分配条件的；二、公司合并、分立、转让主要财产；三、公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散原因出现的，股东大会通过修改章程的决议使公司，四是请求解散公司。单独或者合计持有公司全体股东表决权百分之十以上的股东，经营管理出现严重困难或者控股股东压制小股东，严重影响小股东利益时，股东可以提起解散公司的诉讼，法院判决后按照有关规定进行清算分配。