1、股权转让双方之间的纠纷应列合同的相对人为被告，涉及到公司利益的，应列公司为第三人。

2、涉及其他股东优先购买权的诉讼纠纷应列出让股权的股东为被告，公司为第三人，涉及其他的股东利益，一并追加为第三人。

3、瑕疵出资股权转让引起的纠纷若是股权受让方明知出让方出资存在瑕疵仍受让的，对未按期足额的欠缴出资部分，债权人或者公司有权将股权受让方列为被告，要求承担连带补充责任。若受让方不知情，不应承担责任，还可以将股权转让方列为被告，要求撤销转让合同。

4、隐名股东或实际出资人转让股权引起的纠纷案件涉及到隐名股东与显名股东纠纷时，一般应将显名股东列为被告；涉及到隐名股东要求显名时，将公司列为被告；涉及到与第三人时，第三人与显名股东的纠纷，将显名股东与公司列为共同被告。第三人与隐名股东，第三人应将隐名股东列为被告。

如何避免员工股权纠纷

如果你已经给员工配置了实名工商登记的股份，那么这几点就必须要注意：

（一）章程规定

作为公司宪法的章程，对公司和全体股东都是具有法律效力的，因而如公司章程规定持股员工离职时必须退股，并明确规定了退股方式，那么签署章程的股东便要遵守章程，该规定是合法有效的。

需要注意的是，如员工股东持股后，公司通过修改章程规定持股员工离职时必须退股，且未经员工同意，则不能对员工发生效力。

（二）持股协议中约定

股权本质上也是一种财产。因此，如何处分是尊重意思自治的，自然可以通过合同约定的方式进行处理。与章程不同，合同是具有相对性的，合同约束的对象仅限于签订者。因此，应该在持股协议中将这些都明确说明，包括但不限于持股比例、价格、退出方式、回购价格等等。

《最高人民法院关于适用＜中华人民共和国公司法＞若干问题的规定》第二十四条有限责任公司的实际出资人与名义出资人订立合同，约定由实际出资人出资并享有投资权益，以名义出资人为名义股东，实际出资人与名义股东对该合同效力发生争议的，如无法律规定的无效情形，人民法院应当认定该合同有效。

前款规定的实际出资人与名义股东因投资权益的归属发生争议，实际出资人以其实际履行了出资义务为由向名义股东主张权利的，人民法院应予支持。名义股东以公司股东名册记载、公司登记机关登记为由否认实际出资人权利的，人民法院不予支持。

实际出资人未经公司其他股东半数以上同意，请求公司变更股东、签发出资证明书、记载于股东名册、记载于公司章程并办理公司登记机关登记的，人民法院不予支持。