交完罚款还是违法未处理的原因可能有：

1、查询系统存在延迟，缴纳罚款的信息不能及时同同步，可以过段时间再查询；

2、用户可能网络不稳定，新的消息没有及时刷新，建议网络好的时候刷新系统；

3、工作人员对于处理结果还没有录入，因此还没有更新；

4、可以拨打电话询问原因，或者直接到交警大队查询相关内容。

交通违章申诉程序：

1、在了解道路交通法律法规的前提下，首先要确定自己的违章确实是事出有因，有申诉的理由和证据；

2、向当地交警部门拿一张《行政复议申请表》，填写申请表，其中为什么要撤销处罚的原因和理由需要依据事实、清楚明白的写出来；

3、填好《行政复议申请表》以后、携带交警部门开具的《处罚决定书》、身份证、驾驶证、行驶证等相关证件的原件及复印件到交给交警部门进行办理4、等待申诉结果，一般一周之内申诉结果就会出来，到时候就知道申诉是否成功。

法律依据：《道路交通安全违法行为处理程序规定》第十九条

交通技术监控设备收集违法行为记录资料后五日内，违法行为发生地公安机关交通管理部门应当对记录内容进行审核，经审核无误后录入道路交通违法信息管理系统，作为处罚违法行为的证据。

第二十条

交通技术监控设备记录的违法行为信息录入道路交通违法信息管理系统后当日，违法行为发生地和机动车登记地公安机关交通管理部门应当向社会提供查询。

违法行为发生地公安机关交通管理部门应当在违法行为信息录入道路交通违法信息管理系统后五日内，按照机动车备案信息中的联系方式，通过移动互联网应用程序、手机短信或者邮寄等方式将违法时间、地点、事实通知违法行为人或者机动车所有人、管理人，并告知其在三十日内接受处理。

机动车违章罚款交完后系统多久能查到

机动车违章罚款交完后系统最快20分钟后能查到。外地交款（不论是外地车在本地、还是本地车在外地）会有数据传输时间差，但是一般会在3天以内。由于公安内网和互联网不同步，在互联网查询会显示未交款，数据更新较慢，大概需要3－7个工作日（周末、节假日除外），如果还未对账成功，可带上缴款凭证到处理违章的交警队对账章查询情况。