二套房４６万缴多少税的问题，根据现行政策：１、契税。９０平米以下契税１％，９０－１４０平米契税１．５％，１４０平米以上契税３％，这是购买首套房的契税税率，二套房契税一律３％。例如：商业住宅，是不限购的住房，规定此类住房征收全额契税３％没有优惠，普通商品房住房，规定是首套买入前提９０平以下契税１％，９０平米以上１．５％。如二套买入９０平米以下契税１．５％，９０平以上契税２％，三套及三套以上契税３％。２、个人所得税。购买二套房征的个人所得税为１％。如果个人转让自用５年以上而且是家庭的唯一住宅的免征个人所得税。但是如果出售自有住房一年内再次购买的就不免征个人所得税。３、营业税。如果个人将购买不足２年的住房对外销售的，全额征收营业税。如果个人将购买２年以上的住房对外销售的，免征营业税。

一、契税收费标准

首套房缴纳规定如下：1、个人购买普通住房，且该住房为家庭唯一住房的，所购普通商品住宅户型面积在90平方米(含90平方米)以下的，契税按照1%执行；2、户型面积在90平方米到144平方米(含144平方米)的，税率减半征收，即实际税率为1.5%；3、所购住宅户型面积在144平方米以上的，契税税率按照3%征收。二套房缴纳规定如下：购买非普通住房、二套及以上住房，以及商业投资性房产(商铺、办公写字楼、商务公寓等)，均按照3%的税率征税。

二、出售名下第二套房要交税吗

买卖第二套房需要缴税。需要交的税如下：

1、契税买方按照交易总额的3%缴纳，首次购买面积不足90平的普通住宅可以优惠按1%缴纳，首次购买面积超过90平(含90平)的普通住宅可以优惠按1.5%缴纳。

2、税率5.6%，卖方缴纳。根据刚发的新政，满2年的普通住宅免征，满2年的非普通住宅按交易差额乘以税率征收，这里交易差额是指本次网签价减去这套房子上次交易的网签价。

3、个人所得税，按交易差额的20%征收(相当高的税率)，卖方缴纳。满五唯一的住宅免征，所谓满五唯一就是满五年而且这个房子是卖方按家庭为单位的唯一住房。

4、印花税，买卖双方按交易总额各交0.05%，普通住宅免征。

5.土地税，卖方按交易总额1%缴纳，普通住宅免征，非普通住宅满2年免征。