首先，承包人可以先和发包人确认无争议部分的工程造价，将有争议项目单列，与发包人另行协商或向法院提起诉讼。其次，如果发包人没有协商的诚意，承包人应尽快就整个竣工结算造价或有争议部分提起诉讼或仲裁，要求发包人支付工程款和从工程实际交付之日起计算的欠付工程款的利息，避免一拖再拖。

一、工程款结算的诉讼时效起算

工程款结算的诉讼时效起算点的情况如下：

1.结算请求权的诉讼时效应自该权利被侵害时起算，具体表现为发包人怠于履行结算义务的违约行为成立之时。当事人约定自工程竣工验收合格之日起结算工程价款的，工程竣工验收之后，发包人怠于履行该结算义务时，承包人可向法院起诉请求履行，其诉讼请求的时效期间起算点为工程竣工验收合格之日。

2.当事人约定工程竣工验收合格后，由承包人向发包人提交结算文件，发包人在接到结算文件的合约定期限内予以审核并作出答复的，发包人应当在该期限内确确表示同意或不同意该结算结果，表示不同意的，应及时配合承包人重新结算。

3.发包人未在约定期限内答复，则答复期限届满可认定其怠于履行结算义务，诉讼时效自答复期限届满之日起算；发包人在仅约定期限内答复不同意结算结果的，但怠于与承包人进行协商，重新进行结算的，视为其怠于履行配合结算义务，承包人请求结算的诉讼时效自答复期限届满之日起算。

二、交付工程时拖欠工资怎样处理

交付工程时拖欠工资处理如下：工程竣工验收合格后，承包人以发包人拖延结算或拖欠工程款为由拒绝交付工程的，除施工合同另有明确约定外，一般不予支持。

承包人根据合同拒绝交付工程，但拒绝交付工程的价值明显超过发包人欠的工程款，或者欠的工程款金额不大，部分工程不交付会严重影响整个工程的使用，发包人遭受的实际损失由当事人根据过错程度分担。

三、以拖延结算为由拒付工程款如何处理？

工程竣工验收合格后，承包人以发包人拖延结算或欠付工程款为由拒绝交付工程的，一般不予支持，但施工合同另有明确约定的除外。

承包人依据合同约定拒绝交付工程，但其拒绝交付工程的价值明显超出发包人欠付的工程款，或者欠付工程款的数额不大，而部分工程不交付会严重影响整个工程使用的，对发包人因此所受的实际损失，应由当事人根据过错程度予以分担。