一、查明股权转让协议的有效性方法

从下面三个方面确认股权转让协议的效力：

1．股权转让协议的行为人是否具有相应的民事行为能力；如果有相应的民事行为能力，则有效，反之则无效。

2．意思表示是否真实；如果意思表示真实，则有效，反之则无效。

3．是否违反法律或者社会公共利益。如果不违反法律或者社会公共利益，则有效，反之则无效。

二、股权转让的诉讼时效

股权转让的诉讼时效是三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

根据《民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。

诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。

三、公司股权转让税费有哪些费用

1．印花税。股权转让要签股权转让合同或协议，而法规规定交易合同是需要贴花缴纳印花税的；印花税是对签订股权转让合同的双方征收的，双方都需要缴印花税，按所载金额万分之五贴花；

2．增值税。实务中，最常见的股权转让是个人或企业作为持股主体，转让自己持有的未上市企业（公司与合伙企业）的股权；

3．企业所得税。应纳税所得额等于股权转让收入减去股权计税成本后的余额。企业所得税的税率为25％，符合条件的小型微利企业，减按20％的税率征收企业所得税。国家需要重点扶持的高新技术企业，减按15％的税率征收企业所得税。

4．个人所得税。财产转让所得适用百分之二十的比例税率。

《中华人民共和国企业所得税法》第四条

企业所得税的税率为25％。

第二十八条

符合条件的小型微利企业，减按20％的税率征收企业所得税。国家需要重点扶持的高新技术企业，减按15％的税率征收企业所得税。

《中华人民共和国企业所得税法实施条例》（2019修订）：　　第六章　特别纳税调整　　第一百一十八条　企业所得税法第四十五条所称实际税负明显低于企业所得税法第四条第一款规定税率水平，是指低于企业所得税法第四条第一款规定税率的50%。