一、刑事案件应当由哪些机关进行处理

刑事案件应当由如下机关进行处理：

1．人民法院。人民法院负责死刑立即执行、罚金和没收财产的判决以及无罪或者免除刑罚的判决的执行。

2．监狱。对于被判处死刑缓期二年执行、无期徒刑、有期徒刑的罪犯，由公安机关送交监狱执行刑罚。未成年犯监狱负责未成年犯被判处刑罚的执行。

3．公安机关。公安机关负责执行送交执行时余刑不足1年的有期徒刑和拘役缓刑、管制、拘役、剥夺政治权利、监外执行等的执行。

4．检察院。对案件进行侦查起诉等。

二、刑事案件的审理期限

刑事案件审理期限是：

一般在二个月内完成审理，最长不超过三个月时间，但涉及到案情复杂的刑事犯罪活动，是可以按照法律规定的情况向上级部门申请延长审理期限的，但一般不超过六个月。

《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百零八条

人民法院审理公诉案件，应当在受理后二个月以内宣判，至迟不得超过三个月。对于可能判处死刑的案件或者附带民事诉讼的案件，以及有本法第一百五十八条规定情形之一的，经上一级人民法院批准，可以延长三个月；因特殊情况还需要延长的，报请最高人民法院批准。

人民法院改变管辖的案件，从改变后的人民法院收到案件之日起计算审理期限。

人民检察院补充侦查的案件，补充侦查完毕移送人民法院后，人民法院重新计算审理期限。

三、刑事案件与民事案件的区别

1．性质不同。

（1）刑事案件主要是危害社会、触犯刑律应当受到刑罚处罚的犯罪，属于阶级矛盾性质；

（2）民事案件主要是关于民事权利、义务性质的纠纷，属于人民内部矛盾性质。

2．适用的实体法不同。

（1）而刑事案件所适用的法律是《刑法》；

（2）民事案件所适用的实体法是《民法典》、《公司法》、《劳动法》等。

3．适用的程序法不同。

（1）审理刑事案件适用《刑事诉讼法》及司法解释的相关规定进行审理；

（2）审理民事案件适用《民事诉讼法》及司法解释的相关规定进行审理。

4．起诉的主体不同。

《中华人民共和国刑事诉讼法》（2018修正）：第二章　侦查 第十节　侦查终结　　第一百五十八条　下列案件在本法第一百五十六条规定的期限届满不能侦查终结的，经省、自治区、直辖市人民检察院批准或者决定，可以延长二个月：\n（一）交通十分不便的边远地区的重大复杂案件；\n（二）重大的犯罪集团案件；\n　　（三）流窜作案的重大复杂案件；\n（四）犯罪涉及面广，取证困难的重大复杂案件。