因为交易相对人在交易过程中难以有效识别本次交易中所使用的印章是否为公司备案的印章，公司在日常运营中切忌同时使用多枚同一类型的印章。例如公司曾经同时使用两枚行政章又称为法人章对外签订过合同时，现在仅以案涉合同上所盖印章与备案印章不一致为由，主张其为无效印章，将不会得到法院的支持。因为公司的印章不止一枚，说明公司用章混乱，存在同时使用多枚的可能，不仅不能否定在此期间使用的某一印章的效力，而且还可以推定在此期间出现的其他印章可能是公司使用的多枚印章中的一枚。所以一旦公司同时使用两枚或以上的印章，也就是说公司的印章不唯一，就不能以不是备案印章为由，否认现在存在效力争议的印章不是其实际使用过印章。交易相对人不负有审查公司使用的印章真实与否的义务。这必将导致公司在诉讼上面临巨大的灾难性的法律风险。

因此，对于业务分布全国各地的企业，为图业务开展的方便，往往会刻制多枚印章，或者为了诉讼上的便利私刻多枚印章，这一图方便的行为，将给公司的经营带来不确定的风险。在诉讼中，只有在公司用章不具有唯一性的情况下，公司才不能否定某一印章的效力。故对方当事人往往通过主张公司用章不具有唯一性来达到自己的诉讼目的，并从如下几个方面来完成自己应承担的举证责任：

1、收集与该公司以前的签订的合同、文件或证明等用章资料，从中寻找使用过不止一枚印章的证据。

2、查询工商登记资料，寻找该公司存在多枚印章的资料。

3、该公司在其他场合使用或认可过非备案公章的效力。

4、公司提供真伪鉴定的印章样本为不是备案印章。

如果公司同时使用多枚印章时，备案印章与非备案印章在使用效力上并非区别，即使公司制订了多么严格和详细的印章管理制度，也只是公司内部的规定，不得对抗善意的第三人。因此公司法定代表人、实际控制人、股东等发现公司存在同时使用多枚同一类型印章的情形时，应立即制止并收回非备案印章进行封存或销毁，并对封存或销毁的情况进行公证，以确保公司印章使用的唯一性，以防发生不测。