土地纠纷调处的程序因争议双方的主体不同而有不同。依照我国《土地管理法》第十三条规定：

（一）土地所有权和使用权的争议先由当事人协商解决。

（二）土地争议双方协商不成的，由当地人民政府土地管理部门进行调解，签订权属地界协议书。

（三）协商、调解不成的，按《土地管理法》第十三条规定：全民所有制单位之间、集体所有制单位之间、全民所有制单位和集体所有制单位之间的土地所有权和使用权的争议，由区，县级以上人民政府做出处理决定。如属个人之间、个人与全民所有制单位和集体所有制单位之间的土地使用权的争议，由乡级人民政府或区、县级人民政府做出处理决定。

（四）发生严重的侵犯行为，引起重大的财产损失和人身事故，触犯法律的可直接由人民检察院或人民法院处理。

（五）跨越县、市、省级行政管辖区的土地权属争议，各由其上一级人民政府处理。这类纠纷涉及面广，情况复杂的，由省、直辖市、自治区人民政府或国务院的土地管理机关组织有关部门临时组成仲裁委员会进行调解和裁决，并经所在省、直辖市、自治区人民政府或国务院批准执行。

（六）地方单位或个人与驻军发生的土地权属纠纷，由县以上人民政府处理；如当事人双方的土地跨县、市、省的，参照上述规定处理。

（七）当事人对有关政府的处理决定不服的，根据《土地管理法》第十三条规定，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。但土地所有权争议解决之前，任何一方不得改变土地现状，不得破坏地上附着物。

一、农村土地纠纷如何起诉

农村土地纠纷首先应该找乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。如果对人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

法律依据为《中华人民共和国土地管理法》第十六条规定：土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。

关于土地权属争议，本条规定了三种解决的办法：一是争议发生后先由当事人之间进行协商解决。所谓协商，就是指土地所有者或者使用者权属发生争议后，在自愿互谅的基础上直接进行磋商，自行解决。如果协商不成，或者协商达成协议一方反悔，他方可提请人民政府处理。二是当事人协商不成由人民政府处理，单位之间争议由县级以上人民政府处理，个人之间、个人与单位之间发生争议由乡级人民政府或者县级人民政府处理。人民政府收到争议案件后，一般先进行调解，调解不成进行行政裁决。三是当事人对有关人民政府处理决定不服，可以自接到处理决定通知之日起三十日内向人民法院起诉。

二、农村土地纠纷的类型有哪些

（一）无地少地农民与村集体经济组织的纠纷

这一类型大致有以下三种情况：

一是新增人口的承包地问题；

二是在第二轮土地承包之时，个别农户因种种原因，将其承包地部分或全部退回发包方，现又向集体要回承包地；

三是人口变动后承包方主动退回或被集体收回承包地，现在又重新要回承包地，涉及人口有大中专毕业生、到城镇或大城市居住的原村民、在婆家没有得到承包地的出嫁姑娘等。

（二)由土地流转引发的纠纷

这种情形主要是因为土地流转过程中没有签订土地流转合同，或者即使有土地流转合同，但对土地流转双方的权利和义务关系规定不明确，随着土地预期收益的变化，单方要求终止承包合同、提高土地流转费用等。

(三）由于基层组织违规操作而引发的纠纷

如个别村庄在第一轮土地承包到期时，发包方未按当时“大稳定、小调整”的原则对承包地作适当调整，导致人均承包地面积不均，现在承包地少的农户强烈要求重新发包承包地。有的基层组织借农业结构调整、农业产业化基地建设、引进项目之名，强行流转农户承包地，甚至私下卖掉土地使用权，矛盾随着土地预期收益提高而激化。