1、1999年3月12日，国家计委、财政部发布了“植物新品种保护申请费、审查费和年费标准通知”，指出农业部和国家林业局在接受、审查和授予植物新品种保护权时，可以向申请人收取申请费，新品种保护权的审查费和年费，以及新品种保护权的申请费。每种1800元，每种植物新品种的保护权审查费为4600元，由审批机关根据审批机关的实际费用向申请人收取试验费。新品种保护权的年费从保护期的第一年到第三年，每年1500元，根据前三年的收费标准，以后每三年可以增加30%，从1999年4月1日起实施。

2、2007年8月9日，国家发改委和财政部发布了“关于调整植物新品种保护收费标准的通知”，指出农业部和国家林业局正在接受、审查和授予保护植物新品种的权利。每种植物新品种的保护权申请费从1800元降低到1000元。每个品种的考试费从4600元降至2500元，在保护期内，第一年至第六年年费为1000元，其后年费为1500元。此外，自2007年9月1日起，农业部和国家林业局不允许向申请人收取任何其他费用，如测试费。

3、2015年9月1日，国家发展和改革委员会，财政部发布“关于降低住房转让费和部分行政费用接受商标的通知”，并称2015年10月15日起，降低。而城乡建设部门的住房转让费，工商部门接受商标注册费等6个部门，12个行政管理费，在保护新植物品种权，保护期内，年费从1每年6年。

1000元，每年1500元，第一至第六年每年变为1000元，之后每年减少到1200元。

4、但是，为了进一步规范管理和维护权益，按照合理、合法、公平、公正的原则，按照财政部国家发展和改革委员会《关于清理和规范有关政策的通知》的要求，申请费、审查费和保护新植物品种权的年费将从2017年4月1日起暂停。

5、在2017年3月31日前发出申请费、考试费通知或者年费截止日期在2017年3月31日前的，品种权申请人和品种权利代理机构应当按照规定的期限全额缴纳。2017年3月31日以前，由于未按时缴纳有关费用，被视为撤销、放弃或者终止的，恢复请求权在规定的期限内提出的，应当在审查有关费用并全额支付有关费用后才能恢复。那些在2017年3月31日后应缴的会费，但其费用已支付的，将不予退还。