两者的区别在于：

（1）侵犯的行为对象不同。本罪的行为对象是所有的计算机信息系统；后者局限于国家事务、国防建设、尖端科学技术领域的计算机信息系统。

（2）行为的方式和内容不同。本罪可以在合法使用的或非法侵入的计算机信息系统上实施破坏行为，后者的行为只能是非法侵入，不实施破坏计算机信息系统的行为。

（3）对危害后果要求不同。本罪以后果严重为成立犯罪的必要条件，属于结果犯；后者不要求严重后果发生，属于行为犯。

（4）犯罪动机、目的不同。本罪行为人在主观上具有破坏系统完整性的目的或放任这一危害结果发生的心理状态，而非法侵入计算机信息系统罪的行为人，则并不希望计算机信息系统受到破坏。

（5）本罪具有基本罪和重罪两个构成类型，法定最高刑为十五年有期徒刑；后者是单一的构成类型，法定最高刑为三年有期徒刑。

综合上面所说的，破坏计算机系统这种罪行是属于高科技的犯罪行为，这种行为也会导致他人的利益受到严重的损失，一般只要被认定为犯罪，那么在裁定的量刑上面也会结合案件的大小来进行判决，轻者五年以下，而对于重者就会在五年以上。

本罪与非罪的界限

1、抢劫罪是侵犯财产罪中危害性最大、性质最严重的犯罪。在一般情况下，凡是以非法占有为目的，用暴力、胁迫或者其他方法，强行夺取公私财物的行为，就具备了抢劫罪的基本特征，构成了抢劫罪。立法上没有抢劫的数额和情节的限制性规定。但是依照本法第13条的规定，情节显著轻微危害不大的行为，不认为构成了抢劫罪。例如：青少年偶尔进行恶作剧式的抢劫，行为很有节制、数额极其有限，如强索少量财物，抢吃少量食品等，由于情节显著轻微，危害不大，属于一般违法行为，尚不构成抢劫罪。

2、因为婚姻、家庭纠纷，一方抢回彩礼、陪嫁物，或者强行分割并拿走家庭共有财产的，即使抢回、拿走的份额多了，以及类似的民事纠纷，也属于民事、婚姻纠纷中处理方法不当的问题，不具有非法强占他人财物的目的，不构成抢劫罪。

3、为子女离婚、出嫁女儿暴死等事情所激怒，而纠集亲友多人去砸毁对方家庭财物，抢吃粮菜鸡猪，属于婚姻家庭纠纷中的泄愤、报复行为，一般应做好调解工作，妥善处理，不要作为抢劫论处。

4、根据《最高人民法院关于审理抢劫、抢夺刑事案件适用法律若干问题的意见》第7条第2款规定：“抢劫赌资、犯罪所得的赃款赃物的，以抢劫罪定罪，但行为人仅以其所输赌资或所赢赌债为抢劫对象，一般不以抢劫罪定罪处罚。构成其他犯罪的，依照刑法的相关规定处罚。”即行为人仅以所输赌资或所赢赌资作为抢劫对象的，不构成抢劫罪。

对于抢劫罪的认定和处理情况，应当严格基于上述法律中对于抢劫行为的认定情况而定，特别是对于造成了严重的违法事实的，如抢劫造成了他人严重的人身伤害的，那么还需要追究故意伤害罪的处罚情况，具体情况结合实际而定。