合作社注销债务应该进行清算。应该在解散的事由出现的当天开始十五天之内由成员选出成员组建清算组，开始解散进行清算。超过期限还不能组建清算小组的，则小组成员和债权人可以向人民法院申请指定的成员组建清算小组进行清算，人民法院应该予以受理，并且及时地指定该成员组建清算小组进行清算。

一、公司注销了法人还要负法律责任吗

公司注销了法人是否还需负法律责任要视情况而定，具体情况如下：公司注销后，公司已经宣告终止，不能再追究公司的责任了。但如果属于注销前依法经过清算，则债权人可以该公司的清算组成员为被告，向人民法院起诉，请求判令其偿还公司债务。

公司注销是指当一个公司宣告破产，被其它公司收购、规定的营业期限届满不续、或公司内部解散等情形时，公司需要到登记机关申请注销，终止公司法人资格的过程。

注销公司依法需按照如下步骤组织清算后，方能办理注销登记，终止公司法人资格：

1、依法成立清算组。公司应当在解散事由出现之日起十五日内成立清算组，开始清算。有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成；

2、公告并通知债权人申报债权，依法对债权进行登记。清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上公告。债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权；

3、清算组接管公司，展开清算工作；

4、清算组全面清理公司财产、编制资产负债表和财产清单；

5、清算组制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。

二、合作社没有经营过需不需要注销

合作社没有经营过需要注销。合作社注销流程，申请人提交的申请材料齐全、符合法定形式的，登记机关应当当场予以受理，如果不予受理，应该要说明理由。办理注销所需材料如下：

1、清算组负责人或者法定代表人签署的农民专业合作社注销登记申请书；

2、农民专业合作社成员大会或者成员代表大会依法作出的解散决议；农民专业合作社依法被吊销营业执照或者被撤销的文件；

3、成员大会或者成员代表大会确认的清算报告和人民法院确认的清算报告；

4、成员大会或者成员代表大会作出的债务清偿或者债务担保情况的说明。