合作医疗报销有时间限制。农村合作医疗报销期限各地规定不一样，一般是规定在当年报销，跨年度的不超过一季度。跨结算年度2个月，原则上不予结算。参合农民患病住院，可在全市范围内自由选择定点医疗机构就诊。

确因病情需要转到市外医疗机构就诊的，患者本人或其亲属必须在3个工作日内报市合管中心备案，以便核查。转至市外住院的医疗机构必须是公立二级以上医疗机构。

在外务工的参合农民，因病在当地公立医疗机构就诊，由本人或其家属在3个工作日内向市合管中心申请备案，其发生的符合新型农村合作医疗支付范围的住院费用，先由个人垫付，治疗终结后凭当地公立医疗机构提供的出院记录、住院收费清单、收费收据，到市合作医疗经办机构申请办理补偿手续，经审核符合补偿条件的按市外医疗机构报销比例予以补偿。

农村合作医疗报销时间

有时间限制，当年发生的医疗费原则上在次年的1月底前必须结清。

报销范围：

1、门诊报销：

（1）村卫生室及村中心卫生室就诊报销60％，每次就诊处方药费限额10元，卫生院医生临时补液处方药费限额50元。

（2）镇卫生院就诊报销40％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额100元。

（3）二级医院就诊报销30％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。

（4）三级医院就诊报销20％，每次就诊各项检查费及手术费限额50元，处方药费限额200元。

（5）中药发票附上处方每贴限额1元。

（6）镇级合作医疗门诊补偿年限额5000元。

2、住院报销范围：

A、药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额200元；手术费（参照国家标准，超过1000元的按1000元报销）。

B、60周岁以上老人在镇卫生院住院，治疗费和护理费每天补偿10元，限额200元。

3、大病报销：

（1）镇风险基金补偿：凡参加农村合作医疗保险的住院病人一次性或全年累计应报医疗费超过5000元以上分段补偿，即5001－10000元补偿65％，10001－18000元补偿70％。

（2）镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗补偿年限额1．1万元。

据了解，新农村合作医疗报销范围，大致包括门诊补偿、住院补偿以及大病补偿三部分，主要报销参加者在统筹期内因患病在定点医院机构住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、治疗费、手术费、护理费等符合医疗保险报销范围的部分。

《社会保险法》第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。